Protein–RNA interactions for Protein: P28070

PSMB4, Proteasome subunit beta type-4, humanhuman

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB4P28070 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PSMB4P28070 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PSMB4P28070 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PSMB4P28070 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PSMB4P28070 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PSMB4P28070 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PSMB4P28070 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PSMB4P28070 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PSMB4P28070 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PSMB4P28070 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PSMB4P28070 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PSMB4P28070 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PSMB4P28070 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PSMB4P28070 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PSMB4P28070 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PSMB4P28070 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PSMB4P28070 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PSMB4P28070 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PSMB4P28070 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PSMB4P28070 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PSMB4P28070 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PSMB4P28070 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PSMB4P28070 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PSMB4P28070 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PSMB4P28070 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PSMB4P28070 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PSMB4P28070 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PSMB4P28070 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PSMB4P28070 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PSMB4P28070 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PSMB4P28070 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
PSMB4P28070 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PSMB4P28070 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PSMB4P28070 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PSMB4P28070 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PSMB4P28070 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PSMB4P28070 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PSMB4P28070 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PSMB4P28070 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PSMB4P28070 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PSMB4P28070 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
PSMB4P28070 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PSMB4P28070 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PSMB4P28070 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PSMB4P28070 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PSMB4P28070 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
PSMB4P28070 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
PSMB4P28070 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PSMB4P28070 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PSMB4P28070 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PSMB4P28070 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PSMB4P28070 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PSMB4P28070 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PSMB4P28070 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PSMB4P28070 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PSMB4P28070 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PSMB4P28070 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PSMB4P28070 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PSMB4P28070 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PSMB4P28070 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PSMB4P28070 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PSMB4P28070 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PSMB4P28070 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PSMB4P28070 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PSMB4P28070 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PSMB4P28070 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PSMB4P28070 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
PSMB4P28070 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PSMB4P28070 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PSMB4P28070 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PSMB4P28070 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PSMB4P28070 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PSMB4P28070 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PSMB4P28070 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PSMB4P28070 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PSMB4P28070 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PSMB4P28070 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PSMB4P28070 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PSMB4P28070 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PSMB4P28070 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PSMB4P28070 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PSMB4P28070 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PSMB4P28070 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PSMB4P28070 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PSMB4P28070 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PSMB4P28070 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PSMB4P28070 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PSMB4P28070 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
PSMB4P28070 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PSMB4P28070 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PSMB4P28070 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PSMB4P28070 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PSMB4P28070 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PSMB4P28070 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PSMB4P28070 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PSMB4P28070 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PSMB4P28070 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PSMB4P28070 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PSMB4P28070 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PSMB4P28070 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms