Protein–RNA interactions for Protein: P23508

MCC, Colorectal mutant cancer protein, humanhuman

Predictions only

Length 829 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCCP23508 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
MCCP23508 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
MCCP23508 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
MCCP23508 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
MCCP23508 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
MCCP23508 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
MCCP23508 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
MCCP23508 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
MCCP23508 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
MCCP23508 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
MCCP23508 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
MCCP23508 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
MCCP23508 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
MCCP23508 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
MCCP23508 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
MCCP23508 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
MCCP23508 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
MCCP23508 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
MCCP23508 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
MCCP23508 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
MCCP23508 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
MCCP23508 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
MCCP23508 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
MCCP23508 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
MCCP23508 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
MCCP23508 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
MCCP23508 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
MCCP23508 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
MCCP23508 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
MCCP23508 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
MCCP23508 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
MCCP23508 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
MCCP23508 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
MCCP23508 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
MCCP23508 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
MCCP23508 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
MCCP23508 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
MCCP23508 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
MCCP23508 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC29■■■□□ 2.23
MCCP23508 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
MCCP23508 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
MCCP23508 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
MCCP23508 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
MCCP23508 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
MCCP23508 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
MCCP23508 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
MCCP23508 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
MCCP23508 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC28.99■■■□□ 2.23
MCCP23508 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
MCCP23508 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
MCCP23508 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
MCCP23508 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
MCCP23508 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
MCCP23508 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
MCCP23508 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
MCCP23508 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
MCCP23508 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
MCCP23508 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
MCCP23508 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
MCCP23508 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
MCCP23508 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
MCCP23508 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
MCCP23508 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
MCCP23508 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
MCCP23508 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
MCCP23508 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
MCCP23508 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
MCCP23508 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
MCCP23508 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
MCCP23508 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
MCCP23508 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
MCCP23508 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
MCCP23508 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
MCCP23508 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
MCCP23508 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
MCCP23508 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
MCCP23508 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
MCCP23508 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
MCCP23508 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
MCCP23508 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
MCCP23508 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
MCCP23508 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
MCCP23508 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
MCCP23508 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
MCCP23508 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
MCCP23508 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
MCCP23508 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
MCCP23508 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
MCCP23508 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
MCCP23508 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
MCCP23508 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
MCCP23508 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
MCCP23508 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
MCCP23508 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
MCCP23508 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
MCCP23508 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
MCCP23508 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
MCCP23508 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
MCCP23508 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
MCCP23508 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.6 ms