Protein–RNA interactions for Protein: P20396

TRH, Pro-thyrotropin-releasing hormone, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRHP20396 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC38.54■■■■□ 3.76
TRHP20396 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC38.54■■■■□ 3.76
TRHP20396 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.53■■■■□ 3.76
TRHP20396 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.53■■■■□ 3.76
TRHP20396 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC38.52■■■■□ 3.76
TRHP20396 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.52■■■■□ 3.76
TRHP20396 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC38.51■■■■□ 3.76
TRHP20396 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC38.51■■■■□ 3.76
TRHP20396 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.5■■■■□ 3.75
TRHP20396 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.5■■■■□ 3.75
TRHP20396 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC38.5■■■■□ 3.75
TRHP20396 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC38.5■■■■□ 3.75
TRHP20396 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC38.49■■■■□ 3.75
TRHP20396 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.49■■■■□ 3.75
TRHP20396 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC38.49■■■■□ 3.75
TRHP20396 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC38.49■■■■□ 3.75
TRHP20396 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.48■■■■□ 3.75
TRHP20396 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC38.48■■■■□ 3.75
TRHP20396 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC38.48■■■■□ 3.75
TRHP20396 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC38.47■■■■□ 3.75
TRHP20396 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC38.47■■■■□ 3.75
TRHP20396 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
TRHP20396 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
TRHP20396 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.46■■■■□ 3.75
TRHP20396 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
TRHP20396 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
TRHP20396 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
TRHP20396 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC38.45■■■■□ 3.75
TRHP20396 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.45■■■■□ 3.75
TRHP20396 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC38.45■■■■□ 3.75
TRHP20396 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
TRHP20396 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC38.44■■■■□ 3.74
TRHP20396 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC38.44■■■■□ 3.74
TRHP20396 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
TRHP20396 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
TRHP20396 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.42■■■■□ 3.74
TRHP20396 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC38.42■■■■□ 3.74
TRHP20396 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC38.42■■■■□ 3.74
TRHP20396 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
TRHP20396 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC38.4■■■■□ 3.74
TRHP20396 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.39■■■■□ 3.74
TRHP20396 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC38.39■■■■□ 3.74
TRHP20396 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC38.39■■■■□ 3.74
TRHP20396 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.39■■■■□ 3.74
TRHP20396 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.73
TRHP20396 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.73
TRHP20396 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC38.37■■■■□ 3.73
TRHP20396 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC38.37■■■■□ 3.73
TRHP20396 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.37■■■■□ 3.73
TRHP20396 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.36■■■■□ 3.73
TRHP20396 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
TRHP20396 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
TRHP20396 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
TRHP20396 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
TRHP20396 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
TRHP20396 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
TRHP20396 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC38.33■■■■□ 3.73
TRHP20396 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.33■■■■□ 3.73
TRHP20396 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
TRHP20396 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC38.33■■■■□ 3.73
TRHP20396 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.72
TRHP20396 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC38.32■■■■□ 3.72
TRHP20396 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.32■■■■□ 3.72
TRHP20396 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC38.32■■■■□ 3.72
TRHP20396 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
TRHP20396 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC38.31■■■■□ 3.72
TRHP20396 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC38.3■■■■□ 3.72
TRHP20396 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
TRHP20396 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC38.3■■■■□ 3.72
TRHP20396 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC38.29■■■■□ 3.72
TRHP20396 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
TRHP20396 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC38.28■■■■□ 3.72
TRHP20396 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
TRHP20396 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
TRHP20396 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.25■■■■□ 3.71
TRHP20396 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.25■■■■□ 3.71
TRHP20396 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.25■■■■□ 3.71
TRHP20396 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC38.25■■■■□ 3.71
TRHP20396 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC38.25■■■■□ 3.71
TRHP20396 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.24■■■■□ 3.71
TRHP20396 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.24■■■■□ 3.71
TRHP20396 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.24■■■■□ 3.71
TRHP20396 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.24■■■■□ 3.71
TRHP20396 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC38.24■■■■□ 3.71
TRHP20396 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.24■■■■□ 3.71
TRHP20396 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC38.23■■■■□ 3.71
TRHP20396 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC38.23■■■■□ 3.71
TRHP20396 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC38.23■■■■□ 3.71
TRHP20396 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.23■■■■□ 3.71
TRHP20396 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC38.23■■■■□ 3.71
TRHP20396 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.23■■■■□ 3.71
TRHP20396 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
TRHP20396 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC38.21■■■■□ 3.71
TRHP20396 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC38.21■■■■□ 3.71
TRHP20396 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC38.21■■■■□ 3.71
TRHP20396 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.21■■■■□ 3.71
TRHP20396 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC38.21■■■■□ 3.71
TRHP20396 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.21■■■■□ 3.71
TRHP20396 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC38.21■■■■□ 3.71
TRHP20396 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC38.2■■■■□ 3.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms