Protein–RNA interactions for Protein: P19256

CD58, Lymphocyte function-associated antigen 3, humanhuman

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD58P19256 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CD58P19256 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CD58P19256 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CD58P19256 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CD58P19256 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CD58P19256 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CD58P19256 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CD58P19256 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CD58P19256 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CD58P19256 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
CD58P19256 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CD58P19256 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CD58P19256 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
CD58P19256 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
CD58P19256 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CD58P19256 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CD58P19256 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CD58P19256 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CD58P19256 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CD58P19256 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CD58P19256 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CD58P19256 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CD58P19256 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CD58P19256 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CD58P19256 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CD58P19256 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CD58P19256 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CD58P19256 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
CD58P19256 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CD58P19256 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CD58P19256 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
CD58P19256 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CD58P19256 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CD58P19256 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CD58P19256 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CD58P19256 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
CD58P19256 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CD58P19256 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CD58P19256 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CD58P19256 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CD58P19256 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CD58P19256 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CD58P19256 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CD58P19256 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CD58P19256 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CD58P19256 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CD58P19256 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CD58P19256 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CD58P19256 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CD58P19256 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CD58P19256 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CD58P19256 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
CD58P19256 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CD58P19256 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CD58P19256 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CD58P19256 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CD58P19256 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CD58P19256 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CD58P19256 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CD58P19256 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CD58P19256 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CD58P19256 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CD58P19256 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CD58P19256 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CD58P19256 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
CD58P19256 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CD58P19256 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CD58P19256 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CD58P19256 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CD58P19256 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CD58P19256 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CD58P19256 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CD58P19256 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CD58P19256 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CD58P19256 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CD58P19256 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CD58P19256 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CD58P19256 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CD58P19256 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CD58P19256 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CD58P19256 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CD58P19256 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CD58P19256 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CD58P19256 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CD58P19256 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CD58P19256 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CD58P19256 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CD58P19256 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CD58P19256 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
CD58P19256 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CD58P19256 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CD58P19256 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CD58P19256 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CD58P19256 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CD58P19256 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CD58P19256 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
CD58P19256 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CD58P19256 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CD58P19256 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CD58P19256 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms