Protein–RNA interactions for Protein: P17481

HOXB8, Homeobox protein Hox-B8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB8P17481 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
HOXB8P17481 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
HOXB8P17481 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
HOXB8P17481 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
HOXB8P17481 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
HOXB8P17481 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
HOXB8P17481 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
HOXB8P17481 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
HOXB8P17481 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
HOXB8P17481 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
HOXB8P17481 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
HOXB8P17481 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
HOXB8P17481 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
HOXB8P17481 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
HOXB8P17481 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
HOXB8P17481 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
HOXB8P17481 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
HOXB8P17481 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
HOXB8P17481 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
HOXB8P17481 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
HOXB8P17481 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
HOXB8P17481 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
HOXB8P17481 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
HOXB8P17481 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
HOXB8P17481 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
HOXB8P17481 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
HOXB8P17481 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
HOXB8P17481 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
HOXB8P17481 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
HOXB8P17481 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
HOXB8P17481 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
HOXB8P17481 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
HOXB8P17481 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.68
HOXB8P17481 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
HOXB8P17481 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
HOXB8P17481 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
HOXB8P17481 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
HOXB8P17481 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
HOXB8P17481 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
HOXB8P17481 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
HOXB8P17481 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
HOXB8P17481 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
HOXB8P17481 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
HOXB8P17481 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
HOXB8P17481 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
HOXB8P17481 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
HOXB8P17481 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
HOXB8P17481 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
HOXB8P17481 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
HOXB8P17481 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
HOXB8P17481 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
HOXB8P17481 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
HOXB8P17481 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
HOXB8P17481 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
HOXB8P17481 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HOXB8P17481 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HOXB8P17481 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HOXB8P17481 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HOXB8P17481 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
HOXB8P17481 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HOXB8P17481 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HOXB8P17481 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HOXB8P17481 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
HOXB8P17481 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
HOXB8P17481 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
HOXB8P17481 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
HOXB8P17481 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
HOXB8P17481 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HOXB8P17481 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HOXB8P17481 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
HOXB8P17481 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
HOXB8P17481 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
HOXB8P17481 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
HOXB8P17481 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
HOXB8P17481 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HOXB8P17481 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
HOXB8P17481 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
HOXB8P17481 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HOXB8P17481 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
HOXB8P17481 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HOXB8P17481 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
HOXB8P17481 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
HOXB8P17481 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
HOXB8P17481 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
HOXB8P17481 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HOXB8P17481 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
HOXB8P17481 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HOXB8P17481 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HOXB8P17481 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
HOXB8P17481 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
HOXB8P17481 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
HOXB8P17481 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
HOXB8P17481 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
HOXB8P17481 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
HOXB8P17481 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
HOXB8P17481 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
HOXB8P17481 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
HOXB8P17481 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HOXB8P17481 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
HOXB8P17481 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.1 ms