Protein–RNA interactions for Protein: P16333

NCK1, Cytoplasmic protein NCK1, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCK1P16333 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NCK1P16333 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NCK1P16333 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NCK1P16333 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NCK1P16333 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NCK1P16333 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
NCK1P16333 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NCK1P16333 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NCK1P16333 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NCK1P16333 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NCK1P16333 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NCK1P16333 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NCK1P16333 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NCK1P16333 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NCK1P16333 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NCK1P16333 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NCK1P16333 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NCK1P16333 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NCK1P16333 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NCK1P16333 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NCK1P16333 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
NCK1P16333 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NCK1P16333 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NCK1P16333 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NCK1P16333 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NCK1P16333 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NCK1P16333 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NCK1P16333 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NCK1P16333 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NCK1P16333 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NCK1P16333 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NCK1P16333 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NCK1P16333 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
NCK1P16333 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
NCK1P16333 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
NCK1P16333 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NCK1P16333 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NCK1P16333 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NCK1P16333 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NCK1P16333 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NCK1P16333 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NCK1P16333 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NCK1P16333 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NCK1P16333 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NCK1P16333 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NCK1P16333 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NCK1P16333 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NCK1P16333 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NCK1P16333 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NCK1P16333 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NCK1P16333 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NCK1P16333 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NCK1P16333 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
NCK1P16333 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NCK1P16333 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NCK1P16333 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NCK1P16333 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
NCK1P16333 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NCK1P16333 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NCK1P16333 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NCK1P16333 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NCK1P16333 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NCK1P16333 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NCK1P16333 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NCK1P16333 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NCK1P16333 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NCK1P16333 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NCK1P16333 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NCK1P16333 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NCK1P16333 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NCK1P16333 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NCK1P16333 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NCK1P16333 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NCK1P16333 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NCK1P16333 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NCK1P16333 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NCK1P16333 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NCK1P16333 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NCK1P16333 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NCK1P16333 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NCK1P16333 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
NCK1P16333 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NCK1P16333 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NCK1P16333 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NCK1P16333 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NCK1P16333 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NCK1P16333 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NCK1P16333 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NCK1P16333 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NCK1P16333 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NCK1P16333 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NCK1P16333 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NCK1P16333 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
NCK1P16333 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NCK1P16333 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NCK1P16333 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NCK1P16333 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NCK1P16333 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NCK1P16333 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NCK1P16333 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms