Protein–RNA interactions for Protein: P12036

NEFH, Neurofilament heavy polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 1,026 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFHP12036 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NEFHP12036 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NEFHP12036 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NEFHP12036 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NEFHP12036 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NEFHP12036 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NEFHP12036 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NEFHP12036 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NEFHP12036 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NEFHP12036 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NEFHP12036 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NEFHP12036 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NEFHP12036 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NEFHP12036 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NEFHP12036 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NEFHP12036 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NEFHP12036 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NEFHP12036 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NEFHP12036 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
NEFHP12036 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NEFHP12036 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NEFHP12036 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NEFHP12036 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NEFHP12036 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NEFHP12036 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NEFHP12036 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NEFHP12036 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NEFHP12036 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NEFHP12036 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NEFHP12036 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NEFHP12036 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NEFHP12036 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NEFHP12036 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NEFHP12036 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NEFHP12036 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NEFHP12036 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NEFHP12036 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NEFHP12036 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NEFHP12036 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NEFHP12036 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NEFHP12036 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NEFHP12036 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NEFHP12036 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NEFHP12036 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
NEFHP12036 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NEFHP12036 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NEFHP12036 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NEFHP12036 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NEFHP12036 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
NEFHP12036 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NEFHP12036 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NEFHP12036 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NEFHP12036 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NEFHP12036 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NEFHP12036 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NEFHP12036 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NEFHP12036 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NEFHP12036 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NEFHP12036 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NEFHP12036 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NEFHP12036 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NEFHP12036 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NEFHP12036 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NEFHP12036 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NEFHP12036 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NEFHP12036 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NEFHP12036 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NEFHP12036 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NEFHP12036 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NEFHP12036 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NEFHP12036 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NEFHP12036 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NEFHP12036 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NEFHP12036 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NEFHP12036 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NEFHP12036 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NEFHP12036 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NEFHP12036 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NEFHP12036 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NEFHP12036 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NEFHP12036 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NEFHP12036 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NEFHP12036 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NEFHP12036 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NEFHP12036 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NEFHP12036 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NEFHP12036 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NEFHP12036 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NEFHP12036 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NEFHP12036 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NEFHP12036 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NEFHP12036 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NEFHP12036 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NEFHP12036 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NEFHP12036 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
NEFHP12036 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NEFHP12036 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NEFHP12036 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NEFHP12036 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
NEFHP12036 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 165.6 ms