Protein–RNA interactions for Protein: P11844

CRYGA, Gamma-crystallin A, humanhuman

Predictions only

Length 174 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRYGAP11844 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CRYGAP11844 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CRYGAP11844 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CRYGAP11844 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CRYGAP11844 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CRYGAP11844 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CRYGAP11844 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CRYGAP11844 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CRYGAP11844 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CRYGAP11844 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CRYGAP11844 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CRYGAP11844 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CRYGAP11844 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CRYGAP11844 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CRYGAP11844 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CRYGAP11844 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CRYGAP11844 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CRYGAP11844 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CRYGAP11844 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CRYGAP11844 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CRYGAP11844 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CRYGAP11844 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CRYGAP11844 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CRYGAP11844 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CRYGAP11844 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CRYGAP11844 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CRYGAP11844 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CRYGAP11844 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CRYGAP11844 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CRYGAP11844 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CRYGAP11844 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CRYGAP11844 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CRYGAP11844 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CRYGAP11844 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CRYGAP11844 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CRYGAP11844 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CRYGAP11844 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CRYGAP11844 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CRYGAP11844 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CRYGAP11844 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CRYGAP11844 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CRYGAP11844 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CRYGAP11844 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CRYGAP11844 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CRYGAP11844 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CRYGAP11844 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CRYGAP11844 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CRYGAP11844 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CRYGAP11844 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CRYGAP11844 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CRYGAP11844 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CRYGAP11844 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CRYGAP11844 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CRYGAP11844 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CRYGAP11844 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CRYGAP11844 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CRYGAP11844 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CRYGAP11844 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CRYGAP11844 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CRYGAP11844 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CRYGAP11844 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CRYGAP11844 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CRYGAP11844 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CRYGAP11844 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CRYGAP11844 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CRYGAP11844 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CRYGAP11844 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CRYGAP11844 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CRYGAP11844 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CRYGAP11844 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CRYGAP11844 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CRYGAP11844 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CRYGAP11844 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CRYGAP11844 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CRYGAP11844 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CRYGAP11844 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CRYGAP11844 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CRYGAP11844 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CRYGAP11844 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CRYGAP11844 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CRYGAP11844 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CRYGAP11844 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CRYGAP11844 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CRYGAP11844 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CRYGAP11844 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CRYGAP11844 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CRYGAP11844 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CRYGAP11844 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CRYGAP11844 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CRYGAP11844 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CRYGAP11844 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CRYGAP11844 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CRYGAP11844 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CRYGAP11844 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CRYGAP11844 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CRYGAP11844 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CRYGAP11844 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CRYGAP11844 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CRYGAP11844 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CRYGAP11844 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms