Protein–RNA interactions for Protein: P0CX35

RPS4A, 40S ribosomal protein S4-A, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RPS4AP0CX35 YPL136WYPL136W 369 nt6.78□□□□□ -1.32
RPS4AP0CX35 NFI1YOR156C 2181 nt6.78□□□□□ -1.32
RPS4AP0CX35 ATG32YIL146C 1590 nt6.78□□□□□ -1.32
RPS4AP0CX35 YDR029WYDR029W 315 nt6.77□□□□□ -1.33
RPS4AP0CX35 YDR541CYDR541C 1035 nt6.77□□□□□ -1.33
RPS4AP0CX35 AIM23YJL131C 1071 nt6.77□□□□□ -1.33
RPS4AP0CX35 ARL3YPL051W 597 nt6.77□□□□□ -1.33
RPS4AP0CX35 DAP1YPL170W 459 nt6.77□□□□□ -1.33
RPS4AP0CX35 YCL049CYCL049C 939 nt6.77□□□□□ -1.33
RPS4AP0CX35 SHE9YDR393W 1371 nt6.77□□□□□ -1.33
RPS4AP0CX35 CDC16YKL022C 2523 nt6.77□□□□□ -1.33
RPS4AP0CX35 GRX6YDL010W 696 nt6.76□□□□□ -1.33
RPS4AP0CX35 HPT1YDR399W 666 nt6.76□□□□□ -1.33
RPS4AP0CX35 MTR3YGR158C 753 nt6.76□□□□□ -1.33
RPS4AP0CX35 MRPL6YHR147C 645 nt6.76□□□□□ -1.33
RPS4AP0CX35 MPM1YJL066C 759 nt6.76□□□□□ -1.33
RPS4AP0CX35 MTR2YKL186C 555 nt6.76□□□□□ -1.33
RPS4AP0CX35 SML1YML058W 315 nt6.76□□□□□ -1.33
RPS4AP0CX35 YML090WYML090W 387 nt6.76□□□□□ -1.33
RPS4AP0CX35 NCE103YNL036W 666 nt6.76□□□□□ -1.33
RPS4AP0CX35 CSL4YNL232W 879 nt6.76□□□□□ -1.33
RPS4AP0CX35 AAD14YNL331C 1131 nt6.76□□□□□ -1.33
RPS4AP0CX35 TDP1YBR223C 1635 nt6.76□□□□□ -1.33
RPS4AP0CX35 SRF1YDL133W 1314 nt6.76□□□□□ -1.33
RPS4AP0CX35 CEM1YER061C 1329 nt6.76□□□□□ -1.33
RPS4AP0CX35 TUB1YML085C 1344 nt6.76□□□□□ -1.33
RPS4AP0CX35 NUP84YDL116W 2181 nt6.75□□□□□ -1.33
RPS4AP0CX35 ECM27YJR106W 2178 nt6.75□□□□□ -1.33
RPS4AP0CX35 DLD1YDL174C 1764 nt6.75□□□□□ -1.33
RPS4AP0CX35 HFI1YPL254W 1467 nt6.75□□□□□ -1.33
RPS4AP0CX35 HMRA1YCR097W 381 nt6.75□□□□□ -1.33
RPS4AP0CX35 HHY1YEL059W 309 nt6.75□□□□□ -1.33
RPS4AP0CX35 YLF2YHL014C 1218 nt6.75□□□□□ -1.33
RPS4AP0CX35 PUS4YNL292W 1212 nt6.75□□□□□ -1.33
RPS4AP0CX35 GET4YOR164C 939 nt6.75□□□□□ -1.33
RPS4AP0CX35 LGE1YPL055C 999 nt6.75□□□□□ -1.33
RPS4AP0CX35 MPE1YKL059C 1326 nt6.75□□□□□ -1.33
RPS4AP0CX35 HYM1YKL189W 1200 nt6.74□□□□□ -1.33
RPS4AP0CX35 HAS1YMR290C 1518 nt6.74□□□□□ -1.33
RPS4AP0CX35 PLB2YMR006C 2121 nt6.74□□□□□ -1.33
RPS4AP0CX35 RRP14YKL082C 1305 nt6.74□□□□□ -1.33
RPS4AP0CX35 CIA1YDR267C 993 nt6.73□□□□□ -1.33
RPS4AP0CX35 YFT2YDR319C 825 nt6.73□□□□□ -1.33
RPS4AP0CX35 CSM3YMR048W 954 nt6.73□□□□□ -1.33
RPS4AP0CX35 YOR300WYOR300W 309 nt6.73□□□□□ -1.33
RPS4AP0CX35 SPE3YPR069C 882 nt6.73□□□□□ -1.33
RPS4AP0CX35 AMN1YBR158W 1650 nt6.73□□□□□ -1.33
RPS4AP0CX35 CCR4YAL021C 2514 nt6.73□□□□□ -1.33
RPS4AP0CX35 MSG5YNL053W 1470 nt6.73□□□□□ -1.33
RPS4AP0CX35 MPH3YJR160C 1809 nt6.72□□□□□ -1.33
RPS4AP0CX35 PCL2YDL127W 927 nt6.72□□□□□ -1.33
RPS4AP0CX35 PPH22YDL188C 1134 nt6.72□□□□□ -1.33
RPS4AP0CX35 YLL059CYLL059C 507 nt6.72□□□□□ -1.33
RPS4AP0CX35 CLP1YOR250C 1338 nt6.72□□□□□ -1.33
RPS4AP0CX35 DHH1YDL160C 1521 nt6.71□□□□□ -1.33
RPS4AP0CX35 YFL052WYFL052W 1398 nt6.71□□□□□ -1.33
RPS4AP0CX35 PRP9YDL030W 1593 nt6.71□□□□□ -1.34
RPS4AP0CX35 MCH2YKL221W 1422 nt6.71□□□□□ -1.34
RPS4AP0CX35 ERS1YCR075C 783 nt6.71□□□□□ -1.34
RPS4AP0CX35 SRG1SRG1 551 nt6.71□□□□□ -1.34
RPS4AP0CX35 MRPL28YDR462W 444 nt6.71□□□□□ -1.34
RPS4AP0CX35 YSC83YHR017W 1158 nt6.71□□□□□ -1.34
RPS4AP0CX35 YJL047C-AYJL047C-A 135 nt6.71□□□□□ -1.34
RPS4AP0CX35 YLR402WYLR402W 192 nt6.71□□□□□ -1.34
RPS4AP0CX35 YOL162WYOL162W 648 nt6.71□□□□□ -1.34
RPS4AP0CX35 PPS1YBR276C 2424 nt6.7□□□□□ -1.34
RPS4AP0CX35 YDL026WYDL026W 312 nt6.7□□□□□ -1.34
RPS4AP0CX35 SHO1YER118C 1104 nt6.7□□□□□ -1.34
RPS4AP0CX35 YHR112CYHR112C 1137 nt6.7□□□□□ -1.34
RPS4AP0CX35 PSY3YLR376C 729 nt6.7□□□□□ -1.34
RPS4AP0CX35 YOR111WYOR111W 699 nt6.7□□□□□ -1.34
RPS4AP0CX35 HAL1YPR005C 885 nt6.7□□□□□ -1.34
RPS4AP0CX35 NCE102YPR149W 522 nt6.7□□□□□ -1.34
RPS4AP0CX35 CYB2YML054C 1776 nt6.69□□□□□ -1.34
RPS4AP0CX35 BIO3YNR058W 1443 nt6.69□□□□□ -1.34
RPS4AP0CX35 AAD6YFL056C 639 nt6.69□□□□□ -1.34
RPS4AP0CX35 YGL218WYGL218W 651 nt6.69□□□□□ -1.34
RPS4AP0CX35 YHR028W-AYHR028W-A 321 nt6.69□□□□□ -1.34
RPS4AP0CX35 YAL064WYAL064W 285 nt6.69□□□□□ -1.34
RPS4AP0CX35 YNL017CYNL017C 339 nt6.69□□□□□ -1.34
RPS4AP0CX35 SFT2YBL102W 648 nt6.69□□□□□ -1.34
RPS4AP0CX35 YOL099CYOL099C 492 nt6.69□□□□□ -1.34
RPS4AP0CX35 ERG10YPL028W 1197 nt6.69□□□□□ -1.34
RPS4AP0CX35 YSA1YBR111C 696 nt6.69□□□□□ -1.34
RPS4AP0CX35 BRN1YBL097W 2265 nt6.69□□□□□ -1.34
RPS4AP0CX35 TAH18YPR048W 1872 nt6.68□□□□□ -1.34
RPS4AP0CX35 YDR034W-BYDR034W-B 156 nt6.68□□□□□ -1.34
RPS4AP0CX35 YAL045CYAL045C 309 nt6.68□□□□□ -1.34
RPS4AP0CX35 SLZ1YNL196C 897 nt6.68□□□□□ -1.34
RPS4AP0CX35 HTZ1YOL012C 405 nt6.68□□□□□ -1.34
RPS4AP0CX35 SCP1YOR367W 603 nt6.68□□□□□ -1.34
RPS4AP0CX35 YBR226CYBR226C 411 nt6.68□□□□□ -1.34
RPS4AP0CX35 KIN1YDR122W 3195 nt6.68□□□□□ -1.34
RPS4AP0CX35 APE4YHR113W 1473 nt6.67□□□□□ -1.34
RPS4AP0CX35 YIL108WYIL108W 2091 nt6.67□□□□□ -1.34
RPS4AP0CX35 SKI6YGR195W 741 nt6.67□□□□□ -1.34
RPS4AP0CX35 YLR202CYLR202C 327 nt6.67□□□□□ -1.34
RPS4AP0CX35 NDL1YLR254C 570 nt6.67□□□□□ -1.34
RPS4AP0CX35 LDB7YBL006C 543 nt6.67□□□□□ -1.34
RPS4AP0CX35 YOL046CYOL046C 675 nt6.67□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 32.4 ms