Protein–RNA interactions for Protein: P0CL83

STAG3L1, Putative STAG3-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STAG3L1P0CL83 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
STAG3L1P0CL83 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
STAG3L1P0CL83 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
STAG3L1P0CL83 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
STAG3L1P0CL83 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
STAG3L1P0CL83 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
STAG3L1P0CL83 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
STAG3L1P0CL83 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
STAG3L1P0CL83 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
STAG3L1P0CL83 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
STAG3L1P0CL83 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
STAG3L1P0CL83 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
STAG3L1P0CL83 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC26.45■■□□□ 1.82
STAG3L1P0CL83 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
STAG3L1P0CL83 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
STAG3L1P0CL83 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
STAG3L1P0CL83 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
STAG3L1P0CL83 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
STAG3L1P0CL83 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
STAG3L1P0CL83 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
STAG3L1P0CL83 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
STAG3L1P0CL83 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
STAG3L1P0CL83 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
STAG3L1P0CL83 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
STAG3L1P0CL83 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
STAG3L1P0CL83 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
STAG3L1P0CL83 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
STAG3L1P0CL83 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
STAG3L1P0CL83 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
STAG3L1P0CL83 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
STAG3L1P0CL83 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
STAG3L1P0CL83 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
STAG3L1P0CL83 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
STAG3L1P0CL83 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
STAG3L1P0CL83 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
STAG3L1P0CL83 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
STAG3L1P0CL83 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
STAG3L1P0CL83 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
STAG3L1P0CL83 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
STAG3L1P0CL83 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
STAG3L1P0CL83 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
STAG3L1P0CL83 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
STAG3L1P0CL83 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
STAG3L1P0CL83 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
STAG3L1P0CL83 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
STAG3L1P0CL83 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
STAG3L1P0CL83 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
STAG3L1P0CL83 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
STAG3L1P0CL83 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
STAG3L1P0CL83 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
STAG3L1P0CL83 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
STAG3L1P0CL83 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
STAG3L1P0CL83 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
STAG3L1P0CL83 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
STAG3L1P0CL83 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
STAG3L1P0CL83 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
STAG3L1P0CL83 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
STAG3L1P0CL83 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
STAG3L1P0CL83 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
STAG3L1P0CL83 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
STAG3L1P0CL83 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
STAG3L1P0CL83 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
STAG3L1P0CL83 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
STAG3L1P0CL83 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
STAG3L1P0CL83 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
STAG3L1P0CL83 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
STAG3L1P0CL83 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
STAG3L1P0CL83 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
STAG3L1P0CL83 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
STAG3L1P0CL83 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
STAG3L1P0CL83 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
STAG3L1P0CL83 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
STAG3L1P0CL83 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
STAG3L1P0CL83 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
STAG3L1P0CL83 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
STAG3L1P0CL83 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
STAG3L1P0CL83 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
STAG3L1P0CL83 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
STAG3L1P0CL83 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
STAG3L1P0CL83 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
STAG3L1P0CL83 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
STAG3L1P0CL83 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
STAG3L1P0CL83 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
STAG3L1P0CL83 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
STAG3L1P0CL83 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
STAG3L1P0CL83 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
STAG3L1P0CL83 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
STAG3L1P0CL83 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
STAG3L1P0CL83 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
STAG3L1P0CL83 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
STAG3L1P0CL83 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
STAG3L1P0CL83 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
STAG3L1P0CL83 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
STAG3L1P0CL83 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
STAG3L1P0CL83 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
STAG3L1P0CL83 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
STAG3L1P0CL83 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
STAG3L1P0CL83 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
STAG3L1P0CL83 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
STAG3L1P0CL83 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.7 ms