Protein–RNA interactions for Protein: P09430

TNP1, Spermatid nuclear transition protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 55 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNP1P09430 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
TNP1P09430 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
TNP1P09430 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
TNP1P09430 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
TNP1P09430 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
TNP1P09430 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
TNP1P09430 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
TNP1P09430 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
TNP1P09430 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
TNP1P09430 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
TNP1P09430 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
TNP1P09430 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
TNP1P09430 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
TNP1P09430 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
TNP1P09430 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
TNP1P09430 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
TNP1P09430 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
TNP1P09430 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
TNP1P09430 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
TNP1P09430 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
TNP1P09430 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
TNP1P09430 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
TNP1P09430 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
TNP1P09430 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
TNP1P09430 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
TNP1P09430 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
TNP1P09430 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
TNP1P09430 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
TNP1P09430 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
TNP1P09430 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
TNP1P09430 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
TNP1P09430 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
TNP1P09430 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
TNP1P09430 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
TNP1P09430 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
TNP1P09430 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
TNP1P09430 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
TNP1P09430 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
TNP1P09430 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
TNP1P09430 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
TNP1P09430 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
TNP1P09430 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
TNP1P09430 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
TNP1P09430 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
TNP1P09430 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
TNP1P09430 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
TNP1P09430 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
TNP1P09430 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
TNP1P09430 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
TNP1P09430 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
TNP1P09430 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
TNP1P09430 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
TNP1P09430 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
TNP1P09430 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
TNP1P09430 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
TNP1P09430 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
TNP1P09430 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
TNP1P09430 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
TNP1P09430 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
TNP1P09430 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
TNP1P09430 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
TNP1P09430 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
TNP1P09430 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
TNP1P09430 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
TNP1P09430 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
TNP1P09430 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
TNP1P09430 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
TNP1P09430 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
TNP1P09430 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
TNP1P09430 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
TNP1P09430 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
TNP1P09430 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
TNP1P09430 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
TNP1P09430 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
TNP1P09430 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
TNP1P09430 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
TNP1P09430 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
TNP1P09430 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
TNP1P09430 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
TNP1P09430 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
TNP1P09430 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
TNP1P09430 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
TNP1P09430 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
TNP1P09430 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
TNP1P09430 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
TNP1P09430 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
TNP1P09430 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
TNP1P09430 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
TNP1P09430 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
TNP1P09430 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
TNP1P09430 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
TNP1P09430 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
TNP1P09430 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
TNP1P09430 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
TNP1P09430 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
TNP1P09430 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
TNP1P09430 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
TNP1P09430 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
TNP1P09430 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
TNP1P09430 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.3 ms