Protein–RNA interactions for Protein: P09326

CD48, CD48 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD48P09326 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CD48P09326 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CD48P09326 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CD48P09326 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CD48P09326 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CD48P09326 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CD48P09326 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CD48P09326 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CD48P09326 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CD48P09326 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CD48P09326 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CD48P09326 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CD48P09326 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CD48P09326 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CD48P09326 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CD48P09326 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CD48P09326 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CD48P09326 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CD48P09326 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
CD48P09326 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CD48P09326 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CD48P09326 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CD48P09326 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CD48P09326 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
CD48P09326 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
CD48P09326 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CD48P09326 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CD48P09326 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CD48P09326 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
CD48P09326 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CD48P09326 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CD48P09326 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CD48P09326 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CD48P09326 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CD48P09326 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CD48P09326 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CD48P09326 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CD48P09326 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CD48P09326 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CD48P09326 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CD48P09326 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CD48P09326 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CD48P09326 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CD48P09326 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CD48P09326 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CD48P09326 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CD48P09326 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CD48P09326 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CD48P09326 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CD48P09326 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CD48P09326 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CD48P09326 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CD48P09326 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CD48P09326 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CD48P09326 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CD48P09326 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CD48P09326 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CD48P09326 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CD48P09326 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CD48P09326 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CD48P09326 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CD48P09326 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CD48P09326 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CD48P09326 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CD48P09326 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CD48P09326 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CD48P09326 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CD48P09326 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CD48P09326 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CD48P09326 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CD48P09326 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CD48P09326 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CD48P09326 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CD48P09326 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CD48P09326 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CD48P09326 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CD48P09326 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CD48P09326 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CD48P09326 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CD48P09326 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CD48P09326 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CD48P09326 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CD48P09326 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CD48P09326 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CD48P09326 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CD48P09326 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CD48P09326 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CD48P09326 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CD48P09326 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
CD48P09326 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
CD48P09326 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CD48P09326 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.56
CD48P09326 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
CD48P09326 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
CD48P09326 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CD48P09326 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CD48P09326 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CD48P09326 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
CD48P09326 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CD48P09326 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1537.9 ms