Protein–RNA interactions for Protein: P08134

RHOC, Rho-related GTP-binding protein RhoC, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOCP08134 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RHOCP08134 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RHOCP08134 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RHOCP08134 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RHOCP08134 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RHOCP08134 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RHOCP08134 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RHOCP08134 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RHOCP08134 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RHOCP08134 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RHOCP08134 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RHOCP08134 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RHOCP08134 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RHOCP08134 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
RHOCP08134 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RHOCP08134 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RHOCP08134 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RHOCP08134 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RHOCP08134 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RHOCP08134 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RHOCP08134 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
RHOCP08134 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RHOCP08134 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RHOCP08134 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RHOCP08134 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RHOCP08134 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RHOCP08134 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RHOCP08134 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RHOCP08134 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RHOCP08134 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
RHOCP08134 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RHOCP08134 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RHOCP08134 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RHOCP08134 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RHOCP08134 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RHOCP08134 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RHOCP08134 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RHOCP08134 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RHOCP08134 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RHOCP08134 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RHOCP08134 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RHOCP08134 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RHOCP08134 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RHOCP08134 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RHOCP08134 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
RHOCP08134 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RHOCP08134 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RHOCP08134 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RHOCP08134 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RHOCP08134 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RHOCP08134 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RHOCP08134 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RHOCP08134 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RHOCP08134 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RHOCP08134 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
RHOCP08134 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RHOCP08134 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RHOCP08134 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RHOCP08134 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
RHOCP08134 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RHOCP08134 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RHOCP08134 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
RHOCP08134 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RHOCP08134 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RHOCP08134 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RHOCP08134 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RHOCP08134 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RHOCP08134 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
RHOCP08134 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
RHOCP08134 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RHOCP08134 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RHOCP08134 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
RHOCP08134 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RHOCP08134 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RHOCP08134 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RHOCP08134 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RHOCP08134 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RHOCP08134 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
RHOCP08134 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
RHOCP08134 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RHOCP08134 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RHOCP08134 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RHOCP08134 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RHOCP08134 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RHOCP08134 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RHOCP08134 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RHOCP08134 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RHOCP08134 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RHOCP08134 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RHOCP08134 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RHOCP08134 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RHOCP08134 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RHOCP08134 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RHOCP08134 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RHOCP08134 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
RHOCP08134 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
RHOCP08134 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RHOCP08134 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RHOCP08134 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RHOCP08134 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms