Protein–RNA interactions for Protein: P05783

KRT18, Keratin, type I cytoskeletal 18, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT18P05783 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
KRT18P05783 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
KRT18P05783 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
KRT18P05783 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
KRT18P05783 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
KRT18P05783 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
KRT18P05783 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
KRT18P05783 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
KRT18P05783 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
KRT18P05783 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
KRT18P05783 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
KRT18P05783 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
KRT18P05783 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
KRT18P05783 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
KRT18P05783 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
KRT18P05783 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
KRT18P05783 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
KRT18P05783 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
KRT18P05783 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
KRT18P05783 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
KRT18P05783 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
KRT18P05783 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
KRT18P05783 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
KRT18P05783 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
KRT18P05783 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
KRT18P05783 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
KRT18P05783 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
KRT18P05783 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
KRT18P05783 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
KRT18P05783 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
KRT18P05783 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
KRT18P05783 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
KRT18P05783 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
KRT18P05783 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
KRT18P05783 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
KRT18P05783 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
KRT18P05783 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
KRT18P05783 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
KRT18P05783 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
KRT18P05783 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
KRT18P05783 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
KRT18P05783 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
KRT18P05783 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
KRT18P05783 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
KRT18P05783 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
KRT18P05783 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
KRT18P05783 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
KRT18P05783 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
KRT18P05783 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
KRT18P05783 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
KRT18P05783 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
KRT18P05783 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
KRT18P05783 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
KRT18P05783 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
KRT18P05783 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
KRT18P05783 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
KRT18P05783 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
KRT18P05783 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
KRT18P05783 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
KRT18P05783 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
KRT18P05783 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
KRT18P05783 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
KRT18P05783 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
KRT18P05783 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
KRT18P05783 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
KRT18P05783 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
KRT18P05783 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
KRT18P05783 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
KRT18P05783 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
KRT18P05783 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
KRT18P05783 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
KRT18P05783 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
KRT18P05783 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
KRT18P05783 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
KRT18P05783 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
KRT18P05783 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
KRT18P05783 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
KRT18P05783 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
KRT18P05783 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
KRT18P05783 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
KRT18P05783 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
KRT18P05783 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
KRT18P05783 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
KRT18P05783 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
KRT18P05783 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
KRT18P05783 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
KRT18P05783 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
KRT18P05783 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
KRT18P05783 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
KRT18P05783 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
KRT18P05783 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
KRT18P05783 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
KRT18P05783 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
KRT18P05783 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
KRT18P05783 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
KRT18P05783 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
KRT18P05783 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC26.64■■□□□ 1.86
KRT18P05783 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
KRT18P05783 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
KRT18P05783 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms