Protein–RNA interactions for Protein: P01282

VIP, VIP peptides, humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VIPP01282 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
VIPP01282 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
VIPP01282 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
VIPP01282 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
VIPP01282 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
VIPP01282 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
VIPP01282 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
VIPP01282 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
VIPP01282 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
VIPP01282 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
VIPP01282 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
VIPP01282 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
VIPP01282 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
VIPP01282 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
VIPP01282 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
VIPP01282 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
VIPP01282 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
VIPP01282 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
VIPP01282 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
VIPP01282 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
VIPP01282 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
VIPP01282 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
VIPP01282 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
VIPP01282 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
VIPP01282 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
VIPP01282 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
VIPP01282 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
VIPP01282 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
VIPP01282 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
VIPP01282 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
VIPP01282 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
VIPP01282 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
VIPP01282 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
VIPP01282 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
VIPP01282 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
VIPP01282 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
VIPP01282 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
VIPP01282 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
VIPP01282 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
VIPP01282 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
VIPP01282 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
VIPP01282 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
VIPP01282 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
VIPP01282 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
VIPP01282 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
VIPP01282 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
VIPP01282 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
VIPP01282 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
VIPP01282 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
VIPP01282 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
VIPP01282 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
VIPP01282 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
VIPP01282 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
VIPP01282 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
VIPP01282 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
VIPP01282 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
VIPP01282 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
VIPP01282 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
VIPP01282 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
VIPP01282 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
VIPP01282 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
VIPP01282 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
VIPP01282 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
VIPP01282 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
VIPP01282 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
VIPP01282 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
VIPP01282 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
VIPP01282 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
VIPP01282 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
VIPP01282 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
VIPP01282 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
VIPP01282 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
VIPP01282 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
VIPP01282 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
VIPP01282 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
VIPP01282 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
VIPP01282 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
VIPP01282 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
VIPP01282 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
VIPP01282 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
VIPP01282 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
VIPP01282 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
VIPP01282 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
VIPP01282 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
VIPP01282 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
VIPP01282 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
VIPP01282 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
VIPP01282 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
VIPP01282 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
VIPP01282 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
VIPP01282 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
VIPP01282 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
VIPP01282 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
VIPP01282 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
VIPP01282 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
VIPP01282 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
VIPP01282 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
VIPP01282 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
VIPP01282 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
VIPP01282 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.6 ms