Protein–RNA interactions for Protein: O96006

ZBED1, Zinc finger BED domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED1O96006 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ZBED1O96006 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ZBED1O96006 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
ZBED1O96006 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZBED1O96006 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZBED1O96006 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZBED1O96006 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZBED1O96006 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZBED1O96006 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ZBED1O96006 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ZBED1O96006 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
ZBED1O96006 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
ZBED1O96006 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ZBED1O96006 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
ZBED1O96006 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ZBED1O96006 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ZBED1O96006 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ZBED1O96006 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZBED1O96006 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZBED1O96006 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZBED1O96006 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZBED1O96006 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZBED1O96006 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ZBED1O96006 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ZBED1O96006 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ZBED1O96006 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ZBED1O96006 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ZBED1O96006 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
ZBED1O96006 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
ZBED1O96006 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ZBED1O96006 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ZBED1O96006 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZBED1O96006 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZBED1O96006 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZBED1O96006 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZBED1O96006 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZBED1O96006 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZBED1O96006 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZBED1O96006 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZBED1O96006 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZBED1O96006 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ZBED1O96006 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ZBED1O96006 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZBED1O96006 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZBED1O96006 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZBED1O96006 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZBED1O96006 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZBED1O96006 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZBED1O96006 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZBED1O96006 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZBED1O96006 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZBED1O96006 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZBED1O96006 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZBED1O96006 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZBED1O96006 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZBED1O96006 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZBED1O96006 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZBED1O96006 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZBED1O96006 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZBED1O96006 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZBED1O96006 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZBED1O96006 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZBED1O96006 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZBED1O96006 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZBED1O96006 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZBED1O96006 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZBED1O96006 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZBED1O96006 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
ZBED1O96006 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZBED1O96006 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZBED1O96006 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZBED1O96006 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZBED1O96006 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
ZBED1O96006 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZBED1O96006 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZBED1O96006 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZBED1O96006 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZBED1O96006 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZBED1O96006 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZBED1O96006 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZBED1O96006 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZBED1O96006 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZBED1O96006 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZBED1O96006 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZBED1O96006 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZBED1O96006 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
ZBED1O96006 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZBED1O96006 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZBED1O96006 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZBED1O96006 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZBED1O96006 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZBED1O96006 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZBED1O96006 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZBED1O96006 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZBED1O96006 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZBED1O96006 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZBED1O96006 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZBED1O96006 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZBED1O96006 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZBED1O96006 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
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