Protein–RNA interactions for Protein: O95243

MBD4, Methyl-CpG-binding domain protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD4O95243 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
MBD4O95243 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
MBD4O95243 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
MBD4O95243 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
MBD4O95243 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
MBD4O95243 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
MBD4O95243 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
MBD4O95243 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
MBD4O95243 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
MBD4O95243 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
MBD4O95243 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
MBD4O95243 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
MBD4O95243 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
MBD4O95243 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
MBD4O95243 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
MBD4O95243 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
MBD4O95243 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
MBD4O95243 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
MBD4O95243 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
MBD4O95243 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
MBD4O95243 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
MBD4O95243 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
MBD4O95243 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
MBD4O95243 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC28.84■■■□□ 2.21
MBD4O95243 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
MBD4O95243 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
MBD4O95243 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
MBD4O95243 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
MBD4O95243 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
MBD4O95243 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
MBD4O95243 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
MBD4O95243 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
MBD4O95243 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
MBD4O95243 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
MBD4O95243 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
MBD4O95243 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
MBD4O95243 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
MBD4O95243 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
MBD4O95243 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.2
MBD4O95243 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
MBD4O95243 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
MBD4O95243 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
MBD4O95243 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
MBD4O95243 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
MBD4O95243 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
MBD4O95243 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
MBD4O95243 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
MBD4O95243 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
MBD4O95243 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
MBD4O95243 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
MBD4O95243 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
MBD4O95243 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
MBD4O95243 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
MBD4O95243 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
MBD4O95243 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
MBD4O95243 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
MBD4O95243 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
MBD4O95243 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
MBD4O95243 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
MBD4O95243 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
MBD4O95243 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
MBD4O95243 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
MBD4O95243 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
MBD4O95243 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
MBD4O95243 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
MBD4O95243 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
MBD4O95243 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
MBD4O95243 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
MBD4O95243 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
MBD4O95243 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
MBD4O95243 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
MBD4O95243 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
MBD4O95243 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
MBD4O95243 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
MBD4O95243 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
MBD4O95243 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
MBD4O95243 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
MBD4O95243 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
MBD4O95243 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
MBD4O95243 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
MBD4O95243 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
MBD4O95243 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
MBD4O95243 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
MBD4O95243 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
MBD4O95243 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
MBD4O95243 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
MBD4O95243 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
MBD4O95243 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
MBD4O95243 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
MBD4O95243 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
MBD4O95243 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
MBD4O95243 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
MBD4O95243 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC28.72■■■□□ 2.19
MBD4O95243 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
MBD4O95243 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
MBD4O95243 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
MBD4O95243 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
MBD4O95243 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
MBD4O95243 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
MBD4O95243 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.6 ms