Protein–RNA interactions for Protein: O75971

SNAPC5, snRNA-activating protein complex subunit 5, humanhuman

Predictions only

Length 98 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPC5O75971 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SNAPC5O75971 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SNAPC5O75971 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SNAPC5O75971 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SNAPC5O75971 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SNAPC5O75971 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SNAPC5O75971 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SNAPC5O75971 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SNAPC5O75971 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SNAPC5O75971 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SNAPC5O75971 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SNAPC5O75971 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SNAPC5O75971 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SNAPC5O75971 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SNAPC5O75971 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SNAPC5O75971 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SNAPC5O75971 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SNAPC5O75971 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SNAPC5O75971 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
SNAPC5O75971 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SNAPC5O75971 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SNAPC5O75971 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SNAPC5O75971 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SNAPC5O75971 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SNAPC5O75971 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SNAPC5O75971 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SNAPC5O75971 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SNAPC5O75971 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SNAPC5O75971 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SNAPC5O75971 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SNAPC5O75971 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SNAPC5O75971 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SNAPC5O75971 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SNAPC5O75971 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SNAPC5O75971 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SNAPC5O75971 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SNAPC5O75971 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SNAPC5O75971 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNAPC5O75971 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNAPC5O75971 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNAPC5O75971 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNAPC5O75971 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNAPC5O75971 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNAPC5O75971 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNAPC5O75971 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNAPC5O75971 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNAPC5O75971 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNAPC5O75971 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNAPC5O75971 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNAPC5O75971 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNAPC5O75971 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNAPC5O75971 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNAPC5O75971 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNAPC5O75971 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNAPC5O75971 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNAPC5O75971 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNAPC5O75971 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNAPC5O75971 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNAPC5O75971 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNAPC5O75971 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNAPC5O75971 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNAPC5O75971 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNAPC5O75971 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNAPC5O75971 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNAPC5O75971 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNAPC5O75971 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNAPC5O75971 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNAPC5O75971 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNAPC5O75971 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SNAPC5O75971 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNAPC5O75971 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNAPC5O75971 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNAPC5O75971 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNAPC5O75971 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNAPC5O75971 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNAPC5O75971 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNAPC5O75971 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNAPC5O75971 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNAPC5O75971 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNAPC5O75971 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNAPC5O75971 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNAPC5O75971 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNAPC5O75971 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNAPC5O75971 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNAPC5O75971 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNAPC5O75971 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNAPC5O75971 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNAPC5O75971 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNAPC5O75971 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNAPC5O75971 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNAPC5O75971 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNAPC5O75971 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNAPC5O75971 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNAPC5O75971 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNAPC5O75971 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNAPC5O75971 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNAPC5O75971 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNAPC5O75971 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNAPC5O75971 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNAPC5O75971 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 158.8 ms