Protein–RNA interactions for Protein: O75164

KDM4A, Lysine-specific demethylase 4A, humanhuman

Predictions only

Length 1,064 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM4AO75164 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
KDM4AO75164 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
KDM4AO75164 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC28.58■■■□□ 2.17
KDM4AO75164 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
KDM4AO75164 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.16
KDM4AO75164 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
KDM4AO75164 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
KDM4AO75164 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
KDM4AO75164 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
KDM4AO75164 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
KDM4AO75164 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
KDM4AO75164 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
KDM4AO75164 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
KDM4AO75164 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
KDM4AO75164 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
KDM4AO75164 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
KDM4AO75164 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
KDM4AO75164 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
KDM4AO75164 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
KDM4AO75164 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
KDM4AO75164 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
KDM4AO75164 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
KDM4AO75164 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
KDM4AO75164 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
KDM4AO75164 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
KDM4AO75164 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
KDM4AO75164 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
KDM4AO75164 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
KDM4AO75164 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
KDM4AO75164 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
KDM4AO75164 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
KDM4AO75164 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
KDM4AO75164 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
KDM4AO75164 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
KDM4AO75164 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
KDM4AO75164 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
KDM4AO75164 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
KDM4AO75164 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
KDM4AO75164 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
KDM4AO75164 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
KDM4AO75164 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
KDM4AO75164 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
KDM4AO75164 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
KDM4AO75164 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
KDM4AO75164 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
KDM4AO75164 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
KDM4AO75164 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
KDM4AO75164 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
KDM4AO75164 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
KDM4AO75164 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
KDM4AO75164 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
KDM4AO75164 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
KDM4AO75164 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
KDM4AO75164 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
KDM4AO75164 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
KDM4AO75164 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
KDM4AO75164 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
KDM4AO75164 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
KDM4AO75164 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
KDM4AO75164 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
KDM4AO75164 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
KDM4AO75164 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
KDM4AO75164 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
KDM4AO75164 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
KDM4AO75164 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
KDM4AO75164 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
KDM4AO75164 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
KDM4AO75164 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
KDM4AO75164 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
KDM4AO75164 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
KDM4AO75164 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
KDM4AO75164 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
KDM4AO75164 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
KDM4AO75164 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
KDM4AO75164 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
KDM4AO75164 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
KDM4AO75164 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
KDM4AO75164 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
KDM4AO75164 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
KDM4AO75164 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
KDM4AO75164 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
KDM4AO75164 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
KDM4AO75164 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
KDM4AO75164 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
KDM4AO75164 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
KDM4AO75164 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
KDM4AO75164 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
KDM4AO75164 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
KDM4AO75164 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
KDM4AO75164 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
KDM4AO75164 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
KDM4AO75164 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
KDM4AO75164 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
KDM4AO75164 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
KDM4AO75164 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
KDM4AO75164 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
KDM4AO75164 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
KDM4AO75164 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
KDM4AO75164 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
KDM4AO75164 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms