Protein–RNA interactions for Protein: O75145

PPFIA3, Liprin-alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA3O75145 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PPFIA3O75145 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PPFIA3O75145 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PPFIA3O75145 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
PPFIA3O75145 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PPFIA3O75145 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PPFIA3O75145 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PPFIA3O75145 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PPFIA3O75145 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PPFIA3O75145 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
PPFIA3O75145 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PPFIA3O75145 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PPFIA3O75145 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PPFIA3O75145 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PPFIA3O75145 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PPFIA3O75145 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PPFIA3O75145 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PPFIA3O75145 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PPFIA3O75145 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PPFIA3O75145 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PPFIA3O75145 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PPFIA3O75145 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PPFIA3O75145 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PPFIA3O75145 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PPFIA3O75145 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PPFIA3O75145 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PPFIA3O75145 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PPFIA3O75145 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PPFIA3O75145 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PPFIA3O75145 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PPFIA3O75145 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PPFIA3O75145 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PPFIA3O75145 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PPFIA3O75145 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PPFIA3O75145 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
PPFIA3O75145 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PPFIA3O75145 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PPFIA3O75145 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
PPFIA3O75145 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PPFIA3O75145 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PPFIA3O75145 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PPFIA3O75145 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PPFIA3O75145 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PPFIA3O75145 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PPFIA3O75145 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PPFIA3O75145 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC28.01■■■□□ 2.08
PPFIA3O75145 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.08
PPFIA3O75145 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PPFIA3O75145 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PPFIA3O75145 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PPFIA3O75145 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
PPFIA3O75145 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC28■■■□□ 2.07
PPFIA3O75145 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PPFIA3O75145 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PPFIA3O75145 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PPFIA3O75145 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PPFIA3O75145 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PPFIA3O75145 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PPFIA3O75145 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PPFIA3O75145 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PPFIA3O75145 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
PPFIA3O75145 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PPFIA3O75145 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PPFIA3O75145 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PPFIA3O75145 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PPFIA3O75145 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PPFIA3O75145 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PPFIA3O75145 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PPFIA3O75145 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PPFIA3O75145 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PPFIA3O75145 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PPFIA3O75145 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PPFIA3O75145 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
PPFIA3O75145 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PPFIA3O75145 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
PPFIA3O75145 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
PPFIA3O75145 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
PPFIA3O75145 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
PPFIA3O75145 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PPFIA3O75145 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PPFIA3O75145 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PPFIA3O75145 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PPFIA3O75145 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PPFIA3O75145 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PPFIA3O75145 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PPFIA3O75145 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
PPFIA3O75145 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PPFIA3O75145 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
PPFIA3O75145 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PPFIA3O75145 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PPFIA3O75145 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PPFIA3O75145 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PPFIA3O75145 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PPFIA3O75145 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PPFIA3O75145 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PPFIA3O75145 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
PPFIA3O75145 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PPFIA3O75145 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PPFIA3O75145 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PPFIA3O75145 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms