Protein–RNA interactions for Protein: O60513

B4GALT4, Beta-1,4-galactosyltransferase 4, humanhuman

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4GALT4O60513 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
B4GALT4O60513 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
B4GALT4O60513 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
B4GALT4O60513 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
B4GALT4O60513 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
B4GALT4O60513 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
B4GALT4O60513 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
B4GALT4O60513 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
B4GALT4O60513 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
B4GALT4O60513 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
B4GALT4O60513 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
B4GALT4O60513 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
B4GALT4O60513 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
B4GALT4O60513 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
B4GALT4O60513 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
B4GALT4O60513 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
B4GALT4O60513 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
B4GALT4O60513 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
B4GALT4O60513 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
B4GALT4O60513 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
B4GALT4O60513 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
B4GALT4O60513 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
B4GALT4O60513 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
B4GALT4O60513 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
B4GALT4O60513 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
B4GALT4O60513 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
B4GALT4O60513 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
B4GALT4O60513 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
B4GALT4O60513 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
B4GALT4O60513 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
B4GALT4O60513 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
B4GALT4O60513 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
B4GALT4O60513 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
B4GALT4O60513 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
B4GALT4O60513 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
B4GALT4O60513 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
B4GALT4O60513 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
B4GALT4O60513 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
B4GALT4O60513 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
B4GALT4O60513 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
B4GALT4O60513 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
B4GALT4O60513 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
B4GALT4O60513 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
B4GALT4O60513 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
B4GALT4O60513 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
B4GALT4O60513 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
B4GALT4O60513 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
B4GALT4O60513 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
B4GALT4O60513 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
B4GALT4O60513 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
B4GALT4O60513 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
B4GALT4O60513 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
B4GALT4O60513 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
B4GALT4O60513 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
B4GALT4O60513 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
B4GALT4O60513 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
B4GALT4O60513 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
B4GALT4O60513 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
B4GALT4O60513 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC26.84■■□□□ 1.89
B4GALT4O60513 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
B4GALT4O60513 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
B4GALT4O60513 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
B4GALT4O60513 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
B4GALT4O60513 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
B4GALT4O60513 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
B4GALT4O60513 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
B4GALT4O60513 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
B4GALT4O60513 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
B4GALT4O60513 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
B4GALT4O60513 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
B4GALT4O60513 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
B4GALT4O60513 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
B4GALT4O60513 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
B4GALT4O60513 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
B4GALT4O60513 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
B4GALT4O60513 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
B4GALT4O60513 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
B4GALT4O60513 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
B4GALT4O60513 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
B4GALT4O60513 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
B4GALT4O60513 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
B4GALT4O60513 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
B4GALT4O60513 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
B4GALT4O60513 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
B4GALT4O60513 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
B4GALT4O60513 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
B4GALT4O60513 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
B4GALT4O60513 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
B4GALT4O60513 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
B4GALT4O60513 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
B4GALT4O60513 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
B4GALT4O60513 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
B4GALT4O60513 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
B4GALT4O60513 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
B4GALT4O60513 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
B4GALT4O60513 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
B4GALT4O60513 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC26.77■■□□□ 1.88
B4GALT4O60513 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
B4GALT4O60513 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
B4GALT4O60513 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms