Protein–RNA interactions for Protein: O60506

SYNCRIP, Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein Q, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNCRIPO60506 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
SYNCRIPO60506 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SYNCRIPO60506 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SYNCRIPO60506 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SYNCRIPO60506 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SYNCRIPO60506 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SYNCRIPO60506 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SYNCRIPO60506 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SYNCRIPO60506 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
SYNCRIPO60506 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SYNCRIPO60506 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SYNCRIPO60506 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SYNCRIPO60506 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SYNCRIPO60506 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SYNCRIPO60506 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SYNCRIPO60506 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SYNCRIPO60506 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SYNCRIPO60506 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SYNCRIPO60506 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SYNCRIPO60506 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SYNCRIPO60506 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SYNCRIPO60506 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SYNCRIPO60506 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SYNCRIPO60506 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SYNCRIPO60506 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SYNCRIPO60506 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SYNCRIPO60506 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SYNCRIPO60506 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SYNCRIPO60506 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SYNCRIPO60506 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SYNCRIPO60506 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SYNCRIPO60506 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SYNCRIPO60506 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SYNCRIPO60506 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SYNCRIPO60506 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
SYNCRIPO60506 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SYNCRIPO60506 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SYNCRIPO60506 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SYNCRIPO60506 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SYNCRIPO60506 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SYNCRIPO60506 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
SYNCRIPO60506 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SYNCRIPO60506 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SYNCRIPO60506 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SYNCRIPO60506 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SYNCRIPO60506 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
SYNCRIPO60506 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SYNCRIPO60506 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SYNCRIPO60506 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SYNCRIPO60506 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SYNCRIPO60506 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SYNCRIPO60506 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SYNCRIPO60506 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SYNCRIPO60506 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SYNCRIPO60506 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SYNCRIPO60506 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SYNCRIPO60506 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SYNCRIPO60506 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SYNCRIPO60506 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SYNCRIPO60506 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SYNCRIPO60506 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SYNCRIPO60506 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SYNCRIPO60506 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SYNCRIPO60506 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SYNCRIPO60506 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SYNCRIPO60506 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
SYNCRIPO60506 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SYNCRIPO60506 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SYNCRIPO60506 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SYNCRIPO60506 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SYNCRIPO60506 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SYNCRIPO60506 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SYNCRIPO60506 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SYNCRIPO60506 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SYNCRIPO60506 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SYNCRIPO60506 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SYNCRIPO60506 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SYNCRIPO60506 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SYNCRIPO60506 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SYNCRIPO60506 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SYNCRIPO60506 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SYNCRIPO60506 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SYNCRIPO60506 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
SYNCRIPO60506 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SYNCRIPO60506 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SYNCRIPO60506 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SYNCRIPO60506 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SYNCRIPO60506 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SYNCRIPO60506 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SYNCRIPO60506 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SYNCRIPO60506 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SYNCRIPO60506 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SYNCRIPO60506 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SYNCRIPO60506 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SYNCRIPO60506 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SYNCRIPO60506 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SYNCRIPO60506 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SYNCRIPO60506 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SYNCRIPO60506 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SYNCRIPO60506 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms