Protein–RNA interactions for Protein: O60504

SORBS3, Vinexin, humanhuman

Predictions only

Length 671 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SORBS3O60504 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SORBS3O60504 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SORBS3O60504 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.95
SORBS3O60504 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SORBS3O60504 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SORBS3O60504 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SORBS3O60504 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SORBS3O60504 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SORBS3O60504 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SORBS3O60504 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SORBS3O60504 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SORBS3O60504 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SORBS3O60504 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SORBS3O60504 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
SORBS3O60504 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SORBS3O60504 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SORBS3O60504 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SORBS3O60504 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SORBS3O60504 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SORBS3O60504 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SORBS3O60504 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SORBS3O60504 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SORBS3O60504 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SORBS3O60504 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SORBS3O60504 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SORBS3O60504 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SORBS3O60504 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SORBS3O60504 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SORBS3O60504 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SORBS3O60504 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SORBS3O60504 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SORBS3O60504 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
SORBS3O60504 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SORBS3O60504 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SORBS3O60504 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
SORBS3O60504 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SORBS3O60504 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
SORBS3O60504 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
SORBS3O60504 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SORBS3O60504 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SORBS3O60504 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SORBS3O60504 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SORBS3O60504 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SORBS3O60504 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SORBS3O60504 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SORBS3O60504 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SORBS3O60504 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SORBS3O60504 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SORBS3O60504 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SORBS3O60504 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SORBS3O60504 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SORBS3O60504 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SORBS3O60504 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SORBS3O60504 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SORBS3O60504 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SORBS3O60504 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SORBS3O60504 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SORBS3O60504 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SORBS3O60504 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SORBS3O60504 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SORBS3O60504 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SORBS3O60504 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SORBS3O60504 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SORBS3O60504 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SORBS3O60504 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SORBS3O60504 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SORBS3O60504 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SORBS3O60504 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SORBS3O60504 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SORBS3O60504 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SORBS3O60504 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SORBS3O60504 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SORBS3O60504 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SORBS3O60504 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SORBS3O60504 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SORBS3O60504 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SORBS3O60504 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SORBS3O60504 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SORBS3O60504 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SORBS3O60504 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SORBS3O60504 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SORBS3O60504 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SORBS3O60504 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SORBS3O60504 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SORBS3O60504 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SORBS3O60504 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SORBS3O60504 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
SORBS3O60504 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SORBS3O60504 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SORBS3O60504 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SORBS3O60504 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SORBS3O60504 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SORBS3O60504 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SORBS3O60504 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SORBS3O60504 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SORBS3O60504 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SORBS3O60504 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SORBS3O60504 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SORBS3O60504 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SORBS3O60504 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms