Protein–RNA interactions for Protein: O60229

KALRN, Kalirin, humanhuman

Predictions only

Length 2,985 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KALRNO60229 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KALRNO60229 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KALRNO60229 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KALRNO60229 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KALRNO60229 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KALRNO60229 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KALRNO60229 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KALRNO60229 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KALRNO60229 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KALRNO60229 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KALRNO60229 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KALRNO60229 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KALRNO60229 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KALRNO60229 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KALRNO60229 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KALRNO60229 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KALRNO60229 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KALRNO60229 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KALRNO60229 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KALRNO60229 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KALRNO60229 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KALRNO60229 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KALRNO60229 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KALRNO60229 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KALRNO60229 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KALRNO60229 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KALRNO60229 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KALRNO60229 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
KALRNO60229 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
KALRNO60229 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KALRNO60229 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KALRNO60229 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KALRNO60229 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KALRNO60229 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KALRNO60229 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KALRNO60229 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KALRNO60229 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KALRNO60229 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
KALRNO60229 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KALRNO60229 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KALRNO60229 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
KALRNO60229 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KALRNO60229 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KALRNO60229 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
KALRNO60229 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
KALRNO60229 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KALRNO60229 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KALRNO60229 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KALRNO60229 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KALRNO60229 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KALRNO60229 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KALRNO60229 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KALRNO60229 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KALRNO60229 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KALRNO60229 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KALRNO60229 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KALRNO60229 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KALRNO60229 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KALRNO60229 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KALRNO60229 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KALRNO60229 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KALRNO60229 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
KALRNO60229 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KALRNO60229 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KALRNO60229 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KALRNO60229 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KALRNO60229 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KALRNO60229 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KALRNO60229 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KALRNO60229 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KALRNO60229 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KALRNO60229 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KALRNO60229 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KALRNO60229 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KALRNO60229 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KALRNO60229 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KALRNO60229 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KALRNO60229 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
KALRNO60229 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
KALRNO60229 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
KALRNO60229 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KALRNO60229 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KALRNO60229 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
KALRNO60229 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KALRNO60229 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KALRNO60229 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
KALRNO60229 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KALRNO60229 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KALRNO60229 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
KALRNO60229 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KALRNO60229 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KALRNO60229 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KALRNO60229 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KALRNO60229 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KALRNO60229 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KALRNO60229 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KALRNO60229 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KALRNO60229 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
KALRNO60229 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KALRNO60229 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms