Protein–RNA interactions for Protein: O43819

SCO2, Protein SCO2 homolog, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCO2O43819 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SCO2O43819 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCO2O43819 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCO2O43819 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCO2O43819 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCO2O43819 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCO2O43819 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCO2O43819 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCO2O43819 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SCO2O43819 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCO2O43819 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCO2O43819 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCO2O43819 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCO2O43819 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCO2O43819 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCO2O43819 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCO2O43819 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCO2O43819 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCO2O43819 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCO2O43819 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCO2O43819 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SCO2O43819 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCO2O43819 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCO2O43819 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCO2O43819 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCO2O43819 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SCO2O43819 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SCO2O43819 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCO2O43819 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCO2O43819 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCO2O43819 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCO2O43819 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCO2O43819 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCO2O43819 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SCO2O43819 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCO2O43819 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SCO2O43819 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SCO2O43819 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SCO2O43819 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SCO2O43819 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SCO2O43819 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SCO2O43819 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SCO2O43819 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SCO2O43819 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SCO2O43819 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SCO2O43819 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SCO2O43819 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SCO2O43819 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCO2O43819 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCO2O43819 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SCO2O43819 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCO2O43819 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCO2O43819 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCO2O43819 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCO2O43819 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCO2O43819 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCO2O43819 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCO2O43819 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCO2O43819 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCO2O43819 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCO2O43819 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCO2O43819 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCO2O43819 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCO2O43819 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCO2O43819 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCO2O43819 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCO2O43819 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SCO2O43819 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCO2O43819 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCO2O43819 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCO2O43819 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCO2O43819 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCO2O43819 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCO2O43819 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCO2O43819 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCO2O43819 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCO2O43819 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCO2O43819 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SCO2O43819 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCO2O43819 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCO2O43819 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCO2O43819 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCO2O43819 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCO2O43819 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCO2O43819 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCO2O43819 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCO2O43819 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SCO2O43819 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SCO2O43819 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SCO2O43819 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SCO2O43819 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SCO2O43819 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SCO2O43819 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SCO2O43819 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SCO2O43819 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SCO2O43819 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SCO2O43819 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SCO2O43819 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SCO2O43819 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SCO2O43819 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms