Protein–RNA interactions for Protein: O43663

PRC1, Protein regulator of cytokinesis 1, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRC1O43663 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PRC1O43663 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PRC1O43663 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PRC1O43663 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PRC1O43663 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PRC1O43663 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PRC1O43663 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PRC1O43663 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PRC1O43663 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PRC1O43663 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PRC1O43663 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PRC1O43663 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
PRC1O43663 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
PRC1O43663 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PRC1O43663 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PRC1O43663 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PRC1O43663 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PRC1O43663 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PRC1O43663 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PRC1O43663 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PRC1O43663 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PRC1O43663 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PRC1O43663 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PRC1O43663 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PRC1O43663 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PRC1O43663 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PRC1O43663 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PRC1O43663 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PRC1O43663 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PRC1O43663 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PRC1O43663 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PRC1O43663 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PRC1O43663 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PRC1O43663 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PRC1O43663 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PRC1O43663 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PRC1O43663 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PRC1O43663 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PRC1O43663 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PRC1O43663 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PRC1O43663 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PRC1O43663 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PRC1O43663 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PRC1O43663 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PRC1O43663 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PRC1O43663 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PRC1O43663 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PRC1O43663 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PRC1O43663 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PRC1O43663 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PRC1O43663 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PRC1O43663 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PRC1O43663 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
PRC1O43663 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PRC1O43663 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PRC1O43663 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PRC1O43663 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PRC1O43663 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PRC1O43663 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
PRC1O43663 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PRC1O43663 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
PRC1O43663 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PRC1O43663 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
PRC1O43663 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PRC1O43663 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PRC1O43663 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PRC1O43663 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PRC1O43663 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PRC1O43663 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PRC1O43663 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PRC1O43663 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PRC1O43663 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PRC1O43663 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PRC1O43663 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PRC1O43663 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PRC1O43663 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PRC1O43663 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PRC1O43663 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PRC1O43663 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PRC1O43663 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PRC1O43663 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PRC1O43663 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PRC1O43663 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PRC1O43663 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PRC1O43663 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
PRC1O43663 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PRC1O43663 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PRC1O43663 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PRC1O43663 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PRC1O43663 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PRC1O43663 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PRC1O43663 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PRC1O43663 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
PRC1O43663 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
PRC1O43663 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
PRC1O43663 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
PRC1O43663 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
PRC1O43663 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PRC1O43663 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PRC1O43663 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms