Protein–RNA interactions for Protein: O43541

SMAD6, Mothers against decapentaplegic homolog 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD6O43541 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SMAD6O43541 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
SMAD6O43541 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SMAD6O43541 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SMAD6O43541 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SMAD6O43541 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SMAD6O43541 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SMAD6O43541 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SMAD6O43541 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SMAD6O43541 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SMAD6O43541 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SMAD6O43541 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SMAD6O43541 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SMAD6O43541 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SMAD6O43541 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SMAD6O43541 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SMAD6O43541 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SMAD6O43541 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SMAD6O43541 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
SMAD6O43541 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SMAD6O43541 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SMAD6O43541 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
SMAD6O43541 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SMAD6O43541 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SMAD6O43541 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SMAD6O43541 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SMAD6O43541 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SMAD6O43541 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SMAD6O43541 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SMAD6O43541 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SMAD6O43541 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SMAD6O43541 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SMAD6O43541 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
SMAD6O43541 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SMAD6O43541 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SMAD6O43541 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SMAD6O43541 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
SMAD6O43541 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SMAD6O43541 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SMAD6O43541 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SMAD6O43541 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SMAD6O43541 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SMAD6O43541 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SMAD6O43541 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SMAD6O43541 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SMAD6O43541 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SMAD6O43541 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SMAD6O43541 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SMAD6O43541 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
SMAD6O43541 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SMAD6O43541 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SMAD6O43541 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SMAD6O43541 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SMAD6O43541 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SMAD6O43541 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SMAD6O43541 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SMAD6O43541 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SMAD6O43541 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SMAD6O43541 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SMAD6O43541 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SMAD6O43541 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SMAD6O43541 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SMAD6O43541 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SMAD6O43541 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SMAD6O43541 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SMAD6O43541 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SMAD6O43541 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
SMAD6O43541 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SMAD6O43541 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SMAD6O43541 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SMAD6O43541 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SMAD6O43541 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SMAD6O43541 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SMAD6O43541 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SMAD6O43541 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SMAD6O43541 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SMAD6O43541 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SMAD6O43541 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SMAD6O43541 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SMAD6O43541 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SMAD6O43541 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SMAD6O43541 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SMAD6O43541 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SMAD6O43541 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SMAD6O43541 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SMAD6O43541 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SMAD6O43541 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SMAD6O43541 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SMAD6O43541 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SMAD6O43541 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
SMAD6O43541 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
SMAD6O43541 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SMAD6O43541 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
SMAD6O43541 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SMAD6O43541 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SMAD6O43541 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SMAD6O43541 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SMAD6O43541 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
SMAD6O43541 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SMAD6O43541 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms