Protein–RNA interactions for Protein: O43520

ATP8B1, Phospholipid-transporting ATPase IC, humanhuman

Predictions only

Length 1,251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP8B1O43520 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATP8B1O43520 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATP8B1O43520 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATP8B1O43520 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
ATP8B1O43520 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATP8B1O43520 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATP8B1O43520 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATP8B1O43520 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATP8B1O43520 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATP8B1O43520 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ATP8B1O43520 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ATP8B1O43520 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ATP8B1O43520 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ATP8B1O43520 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ATP8B1O43520 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ATP8B1O43520 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ATP8B1O43520 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATP8B1O43520 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATP8B1O43520 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATP8B1O43520 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATP8B1O43520 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATP8B1O43520 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATP8B1O43520 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATP8B1O43520 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATP8B1O43520 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATP8B1O43520 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATP8B1O43520 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATP8B1O43520 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATP8B1O43520 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATP8B1O43520 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATP8B1O43520 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATP8B1O43520 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATP8B1O43520 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
ATP8B1O43520 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ATP8B1O43520 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ATP8B1O43520 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ATP8B1O43520 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATP8B1O43520 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATP8B1O43520 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATP8B1O43520 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATP8B1O43520 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATP8B1O43520 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATP8B1O43520 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATP8B1O43520 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATP8B1O43520 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATP8B1O43520 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATP8B1O43520 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATP8B1O43520 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATP8B1O43520 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATP8B1O43520 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATP8B1O43520 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATP8B1O43520 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATP8B1O43520 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATP8B1O43520 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATP8B1O43520 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATP8B1O43520 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATP8B1O43520 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATP8B1O43520 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATP8B1O43520 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATP8B1O43520 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATP8B1O43520 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ATP8B1O43520 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ATP8B1O43520 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ATP8B1O43520 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ATP8B1O43520 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ATP8B1O43520 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
ATP8B1O43520 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ATP8B1O43520 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ATP8B1O43520 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ATP8B1O43520 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ATP8B1O43520 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ATP8B1O43520 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ATP8B1O43520 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ATP8B1O43520 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ATP8B1O43520 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ATP8B1O43520 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ATP8B1O43520 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ATP8B1O43520 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ATP8B1O43520 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ATP8B1O43520 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ATP8B1O43520 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ATP8B1O43520 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ATP8B1O43520 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ATP8B1O43520 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ATP8B1O43520 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ATP8B1O43520 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ATP8B1O43520 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ATP8B1O43520 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ATP8B1O43520 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ATP8B1O43520 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
ATP8B1O43520 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATP8B1O43520 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATP8B1O43520 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATP8B1O43520 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATP8B1O43520 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATP8B1O43520 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
ATP8B1O43520 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATP8B1O43520 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATP8B1O43520 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATP8B1O43520 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms