Protein–RNA interactions for Protein: O15335

CHAD, Chondroadherin, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHADO15335 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CHADO15335 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CHADO15335 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
CHADO15335 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CHADO15335 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
CHADO15335 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CHADO15335 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CHADO15335 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CHADO15335 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CHADO15335 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CHADO15335 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CHADO15335 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CHADO15335 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
CHADO15335 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CHADO15335 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CHADO15335 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CHADO15335 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CHADO15335 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CHADO15335 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CHADO15335 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
CHADO15335 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
CHADO15335 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CHADO15335 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CHADO15335 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CHADO15335 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CHADO15335 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CHADO15335 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CHADO15335 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CHADO15335 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CHADO15335 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CHADO15335 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CHADO15335 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CHADO15335 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CHADO15335 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CHADO15335 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CHADO15335 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CHADO15335 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
CHADO15335 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CHADO15335 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CHADO15335 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CHADO15335 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CHADO15335 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CHADO15335 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CHADO15335 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CHADO15335 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CHADO15335 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CHADO15335 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CHADO15335 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CHADO15335 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CHADO15335 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CHADO15335 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CHADO15335 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CHADO15335 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CHADO15335 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CHADO15335 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CHADO15335 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CHADO15335 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CHADO15335 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CHADO15335 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CHADO15335 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
CHADO15335 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CHADO15335 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CHADO15335 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CHADO15335 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CHADO15335 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CHADO15335 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CHADO15335 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CHADO15335 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CHADO15335 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CHADO15335 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CHADO15335 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CHADO15335 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CHADO15335 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CHADO15335 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CHADO15335 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CHADO15335 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CHADO15335 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CHADO15335 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CHADO15335 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CHADO15335 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CHADO15335 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CHADO15335 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CHADO15335 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CHADO15335 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CHADO15335 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CHADO15335 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CHADO15335 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CHADO15335 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CHADO15335 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CHADO15335 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CHADO15335 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CHADO15335 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CHADO15335 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CHADO15335 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CHADO15335 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CHADO15335 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CHADO15335 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CHADO15335 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CHADO15335 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CHADO15335 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.2 ms