Protein–RNA interactions for Protein: O14525

ASTN1, Astrotactin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASTN1O14525 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ASTN1O14525 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ASTN1O14525 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ASTN1O14525 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ASTN1O14525 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ASTN1O14525 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC27.57■■■□□ 2
ASTN1O14525 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
ASTN1O14525 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ASTN1O14525 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
ASTN1O14525 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ASTN1O14525 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
ASTN1O14525 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
ASTN1O14525 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ASTN1O14525 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC27.56■■■□□ 2
ASTN1O14525 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
ASTN1O14525 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ASTN1O14525 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
ASTN1O14525 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
ASTN1O14525 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
ASTN1O14525 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC27.55■■■□□ 2
ASTN1O14525 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ASTN1O14525 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ASTN1O14525 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
ASTN1O14525 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
ASTN1O14525 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
ASTN1O14525 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ASTN1O14525 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.53■■■□□ 2
ASTN1O14525 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ASTN1O14525 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC27.53■■■□□ 2
ASTN1O14525 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
ASTN1O14525 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ASTN1O14525 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
ASTN1O14525 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
ASTN1O14525 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC27.52■■■□□ 2
ASTN1O14525 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
ASTN1O14525 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ASTN1O14525 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ASTN1O14525 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ASTN1O14525 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ASTN1O14525 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ASTN1O14525 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ASTN1O14525 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ASTN1O14525 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ASTN1O14525 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ASTN1O14525 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ASTN1O14525 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ASTN1O14525 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ASTN1O14525 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ASTN1O14525 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ASTN1O14525 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ASTN1O14525 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ASTN1O14525 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ASTN1O14525 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ASTN1O14525 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ASTN1O14525 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ASTN1O14525 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ASTN1O14525 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ASTN1O14525 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ASTN1O14525 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
ASTN1O14525 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ASTN1O14525 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ASTN1O14525 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ASTN1O14525 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ASTN1O14525 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ASTN1O14525 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ASTN1O14525 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ASTN1O14525 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ASTN1O14525 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ASTN1O14525 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ASTN1O14525 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ASTN1O14525 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
ASTN1O14525 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
ASTN1O14525 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
ASTN1O14525 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
ASTN1O14525 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ASTN1O14525 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ASTN1O14525 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ASTN1O14525 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ASTN1O14525 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ASTN1O14525 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ASTN1O14525 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
ASTN1O14525 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ASTN1O14525 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
ASTN1O14525 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ASTN1O14525 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ASTN1O14525 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
ASTN1O14525 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
ASTN1O14525 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ASTN1O14525 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ASTN1O14525 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ASTN1O14525 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ASTN1O14525 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ASTN1O14525 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ASTN1O14525 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ASTN1O14525 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ASTN1O14525 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
ASTN1O14525 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
ASTN1O14525 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
ASTN1O14525 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
ASTN1O14525 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms