Protein–RNA interactions for Protein: O00635

TRIM38, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM38, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM38O00635 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIM38O00635 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIM38O00635 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIM38O00635 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIM38O00635 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIM38O00635 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIM38O00635 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRIM38O00635 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRIM38O00635 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRIM38O00635 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRIM38O00635 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
TRIM38O00635 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRIM38O00635 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TRIM38O00635 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRIM38O00635 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRIM38O00635 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRIM38O00635 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRIM38O00635 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRIM38O00635 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
TRIM38O00635 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRIM38O00635 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRIM38O00635 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRIM38O00635 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRIM38O00635 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIM38O00635 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIM38O00635 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIM38O00635 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIM38O00635 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIM38O00635 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIM38O00635 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIM38O00635 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIM38O00635 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRIM38O00635 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRIM38O00635 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRIM38O00635 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRIM38O00635 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRIM38O00635 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRIM38O00635 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
TRIM38O00635 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRIM38O00635 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRIM38O00635 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRIM38O00635 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRIM38O00635 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
TRIM38O00635 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRIM38O00635 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRIM38O00635 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRIM38O00635 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
TRIM38O00635 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRIM38O00635 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRIM38O00635 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRIM38O00635 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRIM38O00635 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRIM38O00635 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRIM38O00635 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRIM38O00635 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
TRIM38O00635 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRIM38O00635 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRIM38O00635 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRIM38O00635 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRIM38O00635 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRIM38O00635 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRIM38O00635 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRIM38O00635 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRIM38O00635 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRIM38O00635 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRIM38O00635 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRIM38O00635 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRIM38O00635 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TRIM38O00635 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TRIM38O00635 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TRIM38O00635 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TRIM38O00635 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRIM38O00635 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRIM38O00635 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRIM38O00635 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRIM38O00635 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRIM38O00635 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRIM38O00635 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRIM38O00635 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRIM38O00635 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRIM38O00635 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRIM38O00635 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
TRIM38O00635 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRIM38O00635 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
TRIM38O00635 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRIM38O00635 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
TRIM38O00635 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRIM38O00635 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRIM38O00635 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRIM38O00635 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRIM38O00635 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRIM38O00635 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRIM38O00635 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRIM38O00635 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRIM38O00635 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRIM38O00635 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRIM38O00635 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRIM38O00635 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRIM38O00635 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRIM38O00635 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.7 ms