Protein–RNA interactions for Protein: O00515

LAD1, Ladinin-1, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAD1O00515 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
LAD1O00515 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
LAD1O00515 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
LAD1O00515 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
LAD1O00515 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
LAD1O00515 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
LAD1O00515 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
LAD1O00515 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
LAD1O00515 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
LAD1O00515 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
LAD1O00515 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
LAD1O00515 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
LAD1O00515 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
LAD1O00515 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
LAD1O00515 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
LAD1O00515 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
LAD1O00515 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
LAD1O00515 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
LAD1O00515 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
LAD1O00515 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
LAD1O00515 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
LAD1O00515 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
LAD1O00515 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
LAD1O00515 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
LAD1O00515 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
LAD1O00515 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
LAD1O00515 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
LAD1O00515 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
LAD1O00515 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
LAD1O00515 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
LAD1O00515 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
LAD1O00515 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
LAD1O00515 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
LAD1O00515 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
LAD1O00515 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
LAD1O00515 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
LAD1O00515 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
LAD1O00515 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
LAD1O00515 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
LAD1O00515 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
LAD1O00515 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
LAD1O00515 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
LAD1O00515 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
LAD1O00515 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
LAD1O00515 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
LAD1O00515 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
LAD1O00515 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
LAD1O00515 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
LAD1O00515 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
LAD1O00515 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
LAD1O00515 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
LAD1O00515 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
LAD1O00515 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
LAD1O00515 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
LAD1O00515 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
LAD1O00515 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
LAD1O00515 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
LAD1O00515 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
LAD1O00515 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
LAD1O00515 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
LAD1O00515 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
LAD1O00515 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
LAD1O00515 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
LAD1O00515 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
LAD1O00515 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
LAD1O00515 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
LAD1O00515 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
LAD1O00515 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
LAD1O00515 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
LAD1O00515 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
LAD1O00515 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
LAD1O00515 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
LAD1O00515 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
LAD1O00515 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
LAD1O00515 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
LAD1O00515 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
LAD1O00515 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
LAD1O00515 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
LAD1O00515 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
LAD1O00515 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
LAD1O00515 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
LAD1O00515 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
LAD1O00515 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
LAD1O00515 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
LAD1O00515 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
LAD1O00515 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
LAD1O00515 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
LAD1O00515 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
LAD1O00515 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
LAD1O00515 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
LAD1O00515 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
LAD1O00515 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
LAD1O00515 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
LAD1O00515 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
LAD1O00515 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
LAD1O00515 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
LAD1O00515 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
LAD1O00515 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
LAD1O00515 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
LAD1O00515 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms