Protein–RNA interactions for Protein: O00303

EIF3F, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit F, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF3FO00303 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
EIF3FO00303 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
EIF3FO00303 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
EIF3FO00303 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
EIF3FO00303 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
EIF3FO00303 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
EIF3FO00303 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
EIF3FO00303 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
EIF3FO00303 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
EIF3FO00303 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
EIF3FO00303 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
EIF3FO00303 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
EIF3FO00303 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
EIF3FO00303 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
EIF3FO00303 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
EIF3FO00303 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
EIF3FO00303 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
EIF3FO00303 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
EIF3FO00303 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
EIF3FO00303 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
EIF3FO00303 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
EIF3FO00303 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
EIF3FO00303 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
EIF3FO00303 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
EIF3FO00303 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
EIF3FO00303 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
EIF3FO00303 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
EIF3FO00303 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
EIF3FO00303 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
EIF3FO00303 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
EIF3FO00303 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
EIF3FO00303 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
EIF3FO00303 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
EIF3FO00303 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
EIF3FO00303 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
EIF3FO00303 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
EIF3FO00303 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
EIF3FO00303 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
EIF3FO00303 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
EIF3FO00303 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
EIF3FO00303 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
EIF3FO00303 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
EIF3FO00303 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
EIF3FO00303 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
EIF3FO00303 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
EIF3FO00303 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
EIF3FO00303 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
EIF3FO00303 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
EIF3FO00303 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
EIF3FO00303 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
EIF3FO00303 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
EIF3FO00303 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
EIF3FO00303 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
EIF3FO00303 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
EIF3FO00303 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
EIF3FO00303 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
EIF3FO00303 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
EIF3FO00303 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
EIF3FO00303 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
EIF3FO00303 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
EIF3FO00303 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
EIF3FO00303 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
EIF3FO00303 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
EIF3FO00303 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
EIF3FO00303 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
EIF3FO00303 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
EIF3FO00303 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
EIF3FO00303 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
EIF3FO00303 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
EIF3FO00303 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
EIF3FO00303 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
EIF3FO00303 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
EIF3FO00303 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
EIF3FO00303 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
EIF3FO00303 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
EIF3FO00303 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
EIF3FO00303 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
EIF3FO00303 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
EIF3FO00303 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EIF3FO00303 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
EIF3FO00303 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
EIF3FO00303 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EIF3FO00303 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EIF3FO00303 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EIF3FO00303 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
EIF3FO00303 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EIF3FO00303 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
EIF3FO00303 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EIF3FO00303 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
EIF3FO00303 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
EIF3FO00303 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
EIF3FO00303 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EIF3FO00303 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EIF3FO00303 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EIF3FO00303 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EIF3FO00303 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
EIF3FO00303 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
EIF3FO00303 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
EIF3FO00303 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EIF3FO00303 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms