Protein–RNA interactions for Protein: O00232

PSMD12, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD12O00232 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PSMD12O00232 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PSMD12O00232 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PSMD12O00232 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PSMD12O00232 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PSMD12O00232 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PSMD12O00232 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PSMD12O00232 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PSMD12O00232 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PSMD12O00232 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PSMD12O00232 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PSMD12O00232 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PSMD12O00232 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PSMD12O00232 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PSMD12O00232 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PSMD12O00232 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PSMD12O00232 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PSMD12O00232 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PSMD12O00232 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PSMD12O00232 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PSMD12O00232 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PSMD12O00232 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PSMD12O00232 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PSMD12O00232 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PSMD12O00232 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PSMD12O00232 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PSMD12O00232 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PSMD12O00232 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PSMD12O00232 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PSMD12O00232 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PSMD12O00232 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PSMD12O00232 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PSMD12O00232 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PSMD12O00232 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PSMD12O00232 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PSMD12O00232 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PSMD12O00232 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PSMD12O00232 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PSMD12O00232 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PSMD12O00232 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PSMD12O00232 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PSMD12O00232 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PSMD12O00232 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PSMD12O00232 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PSMD12O00232 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
PSMD12O00232 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PSMD12O00232 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PSMD12O00232 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PSMD12O00232 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PSMD12O00232 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PSMD12O00232 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PSMD12O00232 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PSMD12O00232 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PSMD12O00232 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PSMD12O00232 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PSMD12O00232 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PSMD12O00232 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PSMD12O00232 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PSMD12O00232 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PSMD12O00232 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PSMD12O00232 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PSMD12O00232 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PSMD12O00232 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PSMD12O00232 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PSMD12O00232 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PSMD12O00232 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PSMD12O00232 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PSMD12O00232 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PSMD12O00232 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PSMD12O00232 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PSMD12O00232 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
PSMD12O00232 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PSMD12O00232 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PSMD12O00232 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PSMD12O00232 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PSMD12O00232 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PSMD12O00232 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PSMD12O00232 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PSMD12O00232 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PSMD12O00232 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PSMD12O00232 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PSMD12O00232 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PSMD12O00232 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PSMD12O00232 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PSMD12O00232 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PSMD12O00232 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PSMD12O00232 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PSMD12O00232 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PSMD12O00232 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
PSMD12O00232 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PSMD12O00232 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PSMD12O00232 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PSMD12O00232 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PSMD12O00232 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PSMD12O00232 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
PSMD12O00232 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PSMD12O00232 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
PSMD12O00232 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PSMD12O00232 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PSMD12O00232 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.8 ms