Protein–RNA interactions for Protein: J3QRK9

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3QRK9 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
J3QRK9 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
J3QRK9 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
J3QRK9 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
J3QRK9 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
J3QRK9 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
J3QRK9 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
J3QRK9 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
J3QRK9 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
J3QRK9 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
J3QRK9 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
J3QRK9 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
J3QRK9 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
J3QRK9 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
J3QRK9 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
J3QRK9 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
J3QRK9 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
J3QRK9 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
J3QRK9 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
J3QRK9 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
J3QRK9 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
J3QRK9 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
J3QRK9 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
J3QRK9 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
J3QRK9 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
J3QRK9 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
J3QRK9 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
J3QRK9 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
J3QRK9 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
J3QRK9 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
J3QRK9 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
J3QRK9 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
J3QRK9 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
J3QRK9 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
J3QRK9 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
J3QRK9 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
J3QRK9 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
J3QRK9 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
J3QRK9 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
J3QRK9 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
J3QRK9 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
J3QRK9 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
J3QRK9 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
J3QRK9 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
J3QRK9 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
J3QRK9 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
J3QRK9 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
J3QRK9 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
J3QRK9 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
J3QRK9 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
J3QRK9 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
J3QRK9 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
J3QRK9 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
J3QRK9 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
J3QRK9 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
J3QRK9 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
J3QRK9 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
J3QRK9 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
J3QRK9 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
J3QRK9 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
J3QRK9 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
J3QRK9 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
J3QRK9 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
J3QRK9 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
J3QRK9 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
J3QRK9 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
J3QRK9 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
J3QRK9 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
J3QRK9 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
J3QRK9 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
J3QRK9 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
J3QRK9 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
J3QRK9 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
J3QRK9 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
J3QRK9 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
J3QRK9 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
J3QRK9 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
J3QRK9 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
J3QRK9 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
J3QRK9 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
J3QRK9 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
J3QRK9 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
J3QRK9 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
J3QRK9 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
J3QRK9 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
J3QRK9 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
J3QRK9 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
J3QRK9 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
J3QRK9 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
J3QRK9 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
J3QRK9 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
J3QRK9 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
J3QRK9 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
J3QRK9 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
J3QRK9 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
J3QRK9 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
J3QRK9 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
J3QRK9 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
J3QRK9 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
J3QRK9 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms