Protein–RNA interactions for Protein: H3BQV1

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3BQV1 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
H3BQV1 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
H3BQV1 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
H3BQV1 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
H3BQV1 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
H3BQV1 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
H3BQV1 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
H3BQV1 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
H3BQV1 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
H3BQV1 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
H3BQV1 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
H3BQV1 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
H3BQV1 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
H3BQV1 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
H3BQV1 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
H3BQV1 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
H3BQV1 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
H3BQV1 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
H3BQV1 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
H3BQV1 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
H3BQV1 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
H3BQV1 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
H3BQV1 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
H3BQV1 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
H3BQV1 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
H3BQV1 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
H3BQV1 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
H3BQV1 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
H3BQV1 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
H3BQV1 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
H3BQV1 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
H3BQV1 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
H3BQV1 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
H3BQV1 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
H3BQV1 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
H3BQV1 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
H3BQV1 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
H3BQV1 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
H3BQV1 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
H3BQV1 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
H3BQV1 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
H3BQV1 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
H3BQV1 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
H3BQV1 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
H3BQV1 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
H3BQV1 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
H3BQV1 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
H3BQV1 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
H3BQV1 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
H3BQV1 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
H3BQV1 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
H3BQV1 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
H3BQV1 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
H3BQV1 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
H3BQV1 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
H3BQV1 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
H3BQV1 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
H3BQV1 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
H3BQV1 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
H3BQV1 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
H3BQV1 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
H3BQV1 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
H3BQV1 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC27.82■■■□□ 2.04
H3BQV1 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
H3BQV1 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
H3BQV1 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
H3BQV1 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
H3BQV1 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
H3BQV1 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
H3BQV1 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
H3BQV1 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
H3BQV1 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
H3BQV1 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
H3BQV1 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
H3BQV1 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
H3BQV1 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
H3BQV1 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
H3BQV1 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
H3BQV1 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
H3BQV1 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
H3BQV1 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
H3BQV1 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
H3BQV1 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
H3BQV1 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
H3BQV1 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
H3BQV1 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
H3BQV1 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
H3BQV1 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
H3BQV1 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
H3BQV1 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
H3BQV1 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC27.76■■■□□ 2.04
H3BQV1 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
H3BQV1 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
H3BQV1 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
H3BQV1 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
H3BQV1 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
H3BQV1 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
H3BQV1 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
H3BQV1 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
H3BQV1 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 158.7 ms