Protein–RNA interactions for Protein: B7Z1M9

C2CD4D, C2 calcium-dependent domain-containing protein 4D, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2CD4DB7Z1M9 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
C2CD4DB7Z1M9 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
C2CD4DB7Z1M9 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
C2CD4DB7Z1M9 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
C2CD4DB7Z1M9 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
C2CD4DB7Z1M9 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
C2CD4DB7Z1M9 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
C2CD4DB7Z1M9 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
C2CD4DB7Z1M9 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
C2CD4DB7Z1M9 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
C2CD4DB7Z1M9 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
C2CD4DB7Z1M9 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
C2CD4DB7Z1M9 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
C2CD4DB7Z1M9 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
C2CD4DB7Z1M9 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
C2CD4DB7Z1M9 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
C2CD4DB7Z1M9 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
C2CD4DB7Z1M9 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
C2CD4DB7Z1M9 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
C2CD4DB7Z1M9 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
C2CD4DB7Z1M9 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
C2CD4DB7Z1M9 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
C2CD4DB7Z1M9 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
C2CD4DB7Z1M9 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
C2CD4DB7Z1M9 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
C2CD4DB7Z1M9 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
C2CD4DB7Z1M9 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
C2CD4DB7Z1M9 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
C2CD4DB7Z1M9 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
C2CD4DB7Z1M9 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
C2CD4DB7Z1M9 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
C2CD4DB7Z1M9 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
C2CD4DB7Z1M9 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
C2CD4DB7Z1M9 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
C2CD4DB7Z1M9 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
C2CD4DB7Z1M9 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
C2CD4DB7Z1M9 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
C2CD4DB7Z1M9 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
C2CD4DB7Z1M9 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
C2CD4DB7Z1M9 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
C2CD4DB7Z1M9 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
C2CD4DB7Z1M9 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
C2CD4DB7Z1M9 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
C2CD4DB7Z1M9 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
C2CD4DB7Z1M9 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
C2CD4DB7Z1M9 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
C2CD4DB7Z1M9 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
C2CD4DB7Z1M9 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
C2CD4DB7Z1M9 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
C2CD4DB7Z1M9 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC25■■□□□ 1.59
C2CD4DB7Z1M9 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
C2CD4DB7Z1M9 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
C2CD4DB7Z1M9 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
C2CD4DB7Z1M9 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
C2CD4DB7Z1M9 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
C2CD4DB7Z1M9 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
C2CD4DB7Z1M9 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
C2CD4DB7Z1M9 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
C2CD4DB7Z1M9 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
C2CD4DB7Z1M9 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
C2CD4DB7Z1M9 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
C2CD4DB7Z1M9 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
C2CD4DB7Z1M9 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
C2CD4DB7Z1M9 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
C2CD4DB7Z1M9 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
C2CD4DB7Z1M9 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
C2CD4DB7Z1M9 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
C2CD4DB7Z1M9 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
C2CD4DB7Z1M9 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
C2CD4DB7Z1M9 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
C2CD4DB7Z1M9 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
C2CD4DB7Z1M9 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
C2CD4DB7Z1M9 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
C2CD4DB7Z1M9 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
C2CD4DB7Z1M9 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
C2CD4DB7Z1M9 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
C2CD4DB7Z1M9 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
C2CD4DB7Z1M9 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
C2CD4DB7Z1M9 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
C2CD4DB7Z1M9 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
C2CD4DB7Z1M9 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
C2CD4DB7Z1M9 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
C2CD4DB7Z1M9 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
C2CD4DB7Z1M9 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
C2CD4DB7Z1M9 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
C2CD4DB7Z1M9 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
C2CD4DB7Z1M9 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
C2CD4DB7Z1M9 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
C2CD4DB7Z1M9 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
C2CD4DB7Z1M9 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
C2CD4DB7Z1M9 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
C2CD4DB7Z1M9 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
C2CD4DB7Z1M9 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
C2CD4DB7Z1M9 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
C2CD4DB7Z1M9 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
C2CD4DB7Z1M9 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
C2CD4DB7Z1M9 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
C2CD4DB7Z1M9 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
C2CD4DB7Z1M9 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
C2CD4DB7Z1M9 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms