Protein–RNA interactions for Protein: B2RXH8

HNRNPCL2, Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein C-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HNRNPCL2B2RXH8 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HNRNPCL2B2RXH8 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HNRNPCL2B2RXH8 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HNRNPCL2B2RXH8 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HNRNPCL2B2RXH8 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HNRNPCL2B2RXH8 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HNRNPCL2B2RXH8 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HNRNPCL2B2RXH8 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HNRNPCL2B2RXH8 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
HNRNPCL2B2RXH8 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HNRNPCL2B2RXH8 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HNRNPCL2B2RXH8 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HNRNPCL2B2RXH8 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
HNRNPCL2B2RXH8 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
HNRNPCL2B2RXH8 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
HNRNPCL2B2RXH8 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
HNRNPCL2B2RXH8 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HNRNPCL2B2RXH8 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
HNRNPCL2B2RXH8 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HNRNPCL2B2RXH8 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HNRNPCL2B2RXH8 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HNRNPCL2B2RXH8 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HNRNPCL2B2RXH8 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HNRNPCL2B2RXH8 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HNRNPCL2B2RXH8 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HNRNPCL2B2RXH8 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HNRNPCL2B2RXH8 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HNRNPCL2B2RXH8 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HNRNPCL2B2RXH8 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HNRNPCL2B2RXH8 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HNRNPCL2B2RXH8 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HNRNPCL2B2RXH8 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HNRNPCL2B2RXH8 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HNRNPCL2B2RXH8 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HNRNPCL2B2RXH8 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HNRNPCL2B2RXH8 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HNRNPCL2B2RXH8 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HNRNPCL2B2RXH8 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HNRNPCL2B2RXH8 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HNRNPCL2B2RXH8 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HNRNPCL2B2RXH8 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HNRNPCL2B2RXH8 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HNRNPCL2B2RXH8 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HNRNPCL2B2RXH8 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HNRNPCL2B2RXH8 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HNRNPCL2B2RXH8 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HNRNPCL2B2RXH8 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HNRNPCL2B2RXH8 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HNRNPCL2B2RXH8 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
HNRNPCL2B2RXH8 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HNRNPCL2B2RXH8 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HNRNPCL2B2RXH8 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HNRNPCL2B2RXH8 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HNRNPCL2B2RXH8 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HNRNPCL2B2RXH8 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HNRNPCL2B2RXH8 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HNRNPCL2B2RXH8 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HNRNPCL2B2RXH8 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HNRNPCL2B2RXH8 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HNRNPCL2B2RXH8 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HNRNPCL2B2RXH8 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HNRNPCL2B2RXH8 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HNRNPCL2B2RXH8 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HNRNPCL2B2RXH8 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HNRNPCL2B2RXH8 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HNRNPCL2B2RXH8 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HNRNPCL2B2RXH8 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HNRNPCL2B2RXH8 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HNRNPCL2B2RXH8 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HNRNPCL2B2RXH8 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HNRNPCL2B2RXH8 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HNRNPCL2B2RXH8 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HNRNPCL2B2RXH8 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HNRNPCL2B2RXH8 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HNRNPCL2B2RXH8 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HNRNPCL2B2RXH8 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
HNRNPCL2B2RXH8 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
HNRNPCL2B2RXH8 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
HNRNPCL2B2RXH8 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
HNRNPCL2B2RXH8 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HNRNPCL2B2RXH8 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HNRNPCL2B2RXH8 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HNRNPCL2B2RXH8 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HNRNPCL2B2RXH8 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HNRNPCL2B2RXH8 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HNRNPCL2B2RXH8 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HNRNPCL2B2RXH8 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HNRNPCL2B2RXH8 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HNRNPCL2B2RXH8 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HNRNPCL2B2RXH8 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HNRNPCL2B2RXH8 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
HNRNPCL2B2RXH8 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HNRNPCL2B2RXH8 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
HNRNPCL2B2RXH8 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
HNRNPCL2B2RXH8 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HNRNPCL2B2RXH8 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HNRNPCL2B2RXH8 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HNRNPCL2B2RXH8 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HNRNPCL2B2RXH8 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HNRNPCL2B2RXH8 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms