Protein–RNA interactions for Protein: A6NKF2

ARID3C, AT-rich interactive domain-containing protein 3C, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID3CA6NKF2 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.13■■■■□ 3.69
ARID3CA6NKF2 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.13■■■■□ 3.69
ARID3CA6NKF2 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC38.13■■■■□ 3.69
ARID3CA6NKF2 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.13■■■■□ 3.69
ARID3CA6NKF2 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC38.13■■■■□ 3.69
ARID3CA6NKF2 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC38.13■■■■□ 3.69
ARID3CA6NKF2 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.12■■■■□ 3.69
ARID3CA6NKF2 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC38.12■■■■□ 3.69
ARID3CA6NKF2 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC38.12■■■■□ 3.69
ARID3CA6NKF2 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.12■■■■□ 3.69
ARID3CA6NKF2 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
ARID3CA6NKF2 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
ARID3CA6NKF2 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC38.11■■■■□ 3.69
ARID3CA6NKF2 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC38.11■■■■□ 3.69
ARID3CA6NKF2 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC38.11■■■■□ 3.69
ARID3CA6NKF2 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC38.11■■■■□ 3.69
ARID3CA6NKF2 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
ARID3CA6NKF2 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
ARID3CA6NKF2 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
ARID3CA6NKF2 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC38.1■■■■□ 3.69
ARID3CA6NKF2 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC38.1■■■■□ 3.69
ARID3CA6NKF2 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
ARID3CA6NKF2 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
ARID3CA6NKF2 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
ARID3CA6NKF2 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC38.09■■■■□ 3.69
ARID3CA6NKF2 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC38.09■■■■□ 3.69
ARID3CA6NKF2 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC38.09■■■■□ 3.69
ARID3CA6NKF2 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC38.08■■■■□ 3.69
ARID3CA6NKF2 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC38.08■■■■□ 3.69
ARID3CA6NKF2 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.08■■■■□ 3.69
ARID3CA6NKF2 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
ARID3CA6NKF2 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
ARID3CA6NKF2 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC38.07■■■■□ 3.68
ARID3CA6NKF2 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC38.07■■■■□ 3.68
ARID3CA6NKF2 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC38.07■■■■□ 3.68
ARID3CA6NKF2 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC38.07■■■■□ 3.68
ARID3CA6NKF2 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC38.06■■■■□ 3.68
ARID3CA6NKF2 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
ARID3CA6NKF2 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
ARID3CA6NKF2 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
ARID3CA6NKF2 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC38.05■■■■□ 3.68
ARID3CA6NKF2 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC38.05■■■■□ 3.68
ARID3CA6NKF2 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
ARID3CA6NKF2 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC38.04■■■■□ 3.68
ARID3CA6NKF2 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
ARID3CA6NKF2 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
ARID3CA6NKF2 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC38.04■■■■□ 3.68
ARID3CA6NKF2 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
ARID3CA6NKF2 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
ARID3CA6NKF2 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC38.04■■■■□ 3.68
ARID3CA6NKF2 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC38.04■■■■□ 3.68
ARID3CA6NKF2 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
ARID3CA6NKF2 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
ARID3CA6NKF2 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
ARID3CA6NKF2 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
ARID3CA6NKF2 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
ARID3CA6NKF2 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
ARID3CA6NKF2 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC38.03■■■■□ 3.68
ARID3CA6NKF2 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC38.02■■■■□ 3.68
ARID3CA6NKF2 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC38.02■■■■□ 3.68
ARID3CA6NKF2 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
ARID3CA6NKF2 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.68
ARID3CA6NKF2 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC38.01■■■■□ 3.68
ARID3CA6NKF2 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC38.01■■■■□ 3.68
ARID3CA6NKF2 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC38.01■■■■□ 3.68
ARID3CA6NKF2 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.68
ARID3CA6NKF2 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.67
ARID3CA6NKF2 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.67
ARID3CA6NKF2 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
ARID3CA6NKF2 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
ARID3CA6NKF2 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC38■■■■□ 3.67
ARID3CA6NKF2 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC38■■■■□ 3.67
ARID3CA6NKF2 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
ARID3CA6NKF2 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
ARID3CA6NKF2 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC37.98■■■■□ 3.67
ARID3CA6NKF2 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC37.98■■■■□ 3.67
ARID3CA6NKF2 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC37.98■■■■□ 3.67
ARID3CA6NKF2 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
ARID3CA6NKF2 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.97■■■■□ 3.67
ARID3CA6NKF2 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC37.97■■■■□ 3.67
ARID3CA6NKF2 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC37.97■■■■□ 3.67
ARID3CA6NKF2 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC37.97■■■■□ 3.67
ARID3CA6NKF2 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
ARID3CA6NKF2 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC37.97■■■■□ 3.67
ARID3CA6NKF2 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
ARID3CA6NKF2 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC37.96■■■■□ 3.67
ARID3CA6NKF2 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC37.96■■■■□ 3.67
ARID3CA6NKF2 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
ARID3CA6NKF2 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
ARID3CA6NKF2 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
ARID3CA6NKF2 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
ARID3CA6NKF2 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.96■■■■□ 3.67
ARID3CA6NKF2 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
ARID3CA6NKF2 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
ARID3CA6NKF2 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
ARID3CA6NKF2 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC37.95■■■■□ 3.67
ARID3CA6NKF2 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC37.95■■■■□ 3.67
ARID3CA6NKF2 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
ARID3CA6NKF2 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC37.94■■■■□ 3.66
ARID3CA6NKF2 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC37.94■■■■□ 3.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 126.7 ms