Protein–RNA interactions for Protein: A6NHJ4

ZNF860, Zinc finger protein 860, humanhuman

Predictions only

Length 632 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF860A6NHJ4 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF860A6NHJ4 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF860A6NHJ4 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF860A6NHJ4 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF860A6NHJ4 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF860A6NHJ4 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF860A6NHJ4 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF860A6NHJ4 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF860A6NHJ4 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF860A6NHJ4 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZNF860A6NHJ4 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZNF860A6NHJ4 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
ZNF860A6NHJ4 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ZNF860A6NHJ4 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
ZNF860A6NHJ4 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ZNF860A6NHJ4 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF860A6NHJ4 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF860A6NHJ4 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF860A6NHJ4 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF860A6NHJ4 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF860A6NHJ4 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF860A6NHJ4 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF860A6NHJ4 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF860A6NHJ4 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF860A6NHJ4 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF860A6NHJ4 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF860A6NHJ4 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF860A6NHJ4 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF860A6NHJ4 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF860A6NHJ4 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF860A6NHJ4 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF860A6NHJ4 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF860A6NHJ4 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF860A6NHJ4 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF860A6NHJ4 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF860A6NHJ4 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF860A6NHJ4 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF860A6NHJ4 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF860A6NHJ4 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF860A6NHJ4 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF860A6NHJ4 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF860A6NHJ4 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF860A6NHJ4 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF860A6NHJ4 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF860A6NHJ4 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF860A6NHJ4 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF860A6NHJ4 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF860A6NHJ4 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF860A6NHJ4 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF860A6NHJ4 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF860A6NHJ4 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF860A6NHJ4 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF860A6NHJ4 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF860A6NHJ4 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF860A6NHJ4 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF860A6NHJ4 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF860A6NHJ4 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF860A6NHJ4 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF860A6NHJ4 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF860A6NHJ4 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF860A6NHJ4 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF860A6NHJ4 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF860A6NHJ4 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF860A6NHJ4 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF860A6NHJ4 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF860A6NHJ4 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF860A6NHJ4 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF860A6NHJ4 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF860A6NHJ4 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF860A6NHJ4 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF860A6NHJ4 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF860A6NHJ4 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF860A6NHJ4 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF860A6NHJ4 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF860A6NHJ4 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF860A6NHJ4 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF860A6NHJ4 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF860A6NHJ4 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF860A6NHJ4 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF860A6NHJ4 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF860A6NHJ4 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF860A6NHJ4 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF860A6NHJ4 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF860A6NHJ4 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF860A6NHJ4 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF860A6NHJ4 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF860A6NHJ4 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF860A6NHJ4 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF860A6NHJ4 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF860A6NHJ4 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF860A6NHJ4 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF860A6NHJ4 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF860A6NHJ4 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF860A6NHJ4 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
ZNF860A6NHJ4 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF860A6NHJ4 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF860A6NHJ4 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF860A6NHJ4 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF860A6NHJ4 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF860A6NHJ4 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms