Protein–RNA interactions for Protein: A6NDB9

PALM3, Paralemmin-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 673 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALM3A6NDB9 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PALM3A6NDB9 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PALM3A6NDB9 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PALM3A6NDB9 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PALM3A6NDB9 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PALM3A6NDB9 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PALM3A6NDB9 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PALM3A6NDB9 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PALM3A6NDB9 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PALM3A6NDB9 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PALM3A6NDB9 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PALM3A6NDB9 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PALM3A6NDB9 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PALM3A6NDB9 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PALM3A6NDB9 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PALM3A6NDB9 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PALM3A6NDB9 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PALM3A6NDB9 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
PALM3A6NDB9 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
PALM3A6NDB9 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
PALM3A6NDB9 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
PALM3A6NDB9 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
PALM3A6NDB9 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
PALM3A6NDB9 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
PALM3A6NDB9 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PALM3A6NDB9 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
PALM3A6NDB9 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PALM3A6NDB9 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PALM3A6NDB9 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PALM3A6NDB9 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PALM3A6NDB9 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PALM3A6NDB9 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PALM3A6NDB9 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PALM3A6NDB9 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PALM3A6NDB9 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PALM3A6NDB9 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PALM3A6NDB9 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PALM3A6NDB9 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PALM3A6NDB9 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PALM3A6NDB9 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PALM3A6NDB9 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PALM3A6NDB9 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
PALM3A6NDB9 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PALM3A6NDB9 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
PALM3A6NDB9 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PALM3A6NDB9 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PALM3A6NDB9 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PALM3A6NDB9 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
PALM3A6NDB9 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PALM3A6NDB9 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PALM3A6NDB9 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PALM3A6NDB9 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PALM3A6NDB9 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PALM3A6NDB9 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PALM3A6NDB9 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PALM3A6NDB9 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PALM3A6NDB9 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PALM3A6NDB9 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PALM3A6NDB9 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
PALM3A6NDB9 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
PALM3A6NDB9 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
PALM3A6NDB9 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
PALM3A6NDB9 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PALM3A6NDB9 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PALM3A6NDB9 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PALM3A6NDB9 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PALM3A6NDB9 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PALM3A6NDB9 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PALM3A6NDB9 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
PALM3A6NDB9 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PALM3A6NDB9 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
PALM3A6NDB9 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PALM3A6NDB9 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PALM3A6NDB9 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PALM3A6NDB9 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
PALM3A6NDB9 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PALM3A6NDB9 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PALM3A6NDB9 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PALM3A6NDB9 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PALM3A6NDB9 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PALM3A6NDB9 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PALM3A6NDB9 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PALM3A6NDB9 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
PALM3A6NDB9 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PALM3A6NDB9 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PALM3A6NDB9 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PALM3A6NDB9 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
PALM3A6NDB9 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
PALM3A6NDB9 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PALM3A6NDB9 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PALM3A6NDB9 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PALM3A6NDB9 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PALM3A6NDB9 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
PALM3A6NDB9 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PALM3A6NDB9 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PALM3A6NDB9 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
PALM3A6NDB9 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PALM3A6NDB9 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PALM3A6NDB9 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
PALM3A6NDB9 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111.9 ms