Protein–RNA interactions for Protein: A4IF30

SLC35F4, Solute carrier family 35 member F4, humanhuman

Predictions only

Length 521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC35F4A4IF30 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC35F4A4IF30 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC35F4A4IF30 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC35F4A4IF30 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SLC35F4A4IF30 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SLC35F4A4IF30 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
SLC35F4A4IF30 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SLC35F4A4IF30 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC35F4A4IF30 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC35F4A4IF30 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC35F4A4IF30 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC35F4A4IF30 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC35F4A4IF30 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC35F4A4IF30 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC35F4A4IF30 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC35F4A4IF30 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC35F4A4IF30 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC35F4A4IF30 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC35F4A4IF30 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC35F4A4IF30 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC35F4A4IF30 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC35F4A4IF30 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC35F4A4IF30 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC35F4A4IF30 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC35F4A4IF30 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC35F4A4IF30 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC35F4A4IF30 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC35F4A4IF30 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC35F4A4IF30 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC35F4A4IF30 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC35F4A4IF30 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC35F4A4IF30 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC35F4A4IF30 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC35F4A4IF30 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC35F4A4IF30 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC35F4A4IF30 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC35F4A4IF30 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC35F4A4IF30 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC35F4A4IF30 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC35F4A4IF30 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC35F4A4IF30 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC35F4A4IF30 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC35F4A4IF30 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC35F4A4IF30 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC35F4A4IF30 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC35F4A4IF30 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC35F4A4IF30 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC35F4A4IF30 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC35F4A4IF30 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC35F4A4IF30 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC35F4A4IF30 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
SLC35F4A4IF30 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
SLC35F4A4IF30 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
SLC35F4A4IF30 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
SLC35F4A4IF30 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
SLC35F4A4IF30 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
SLC35F4A4IF30 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC35F4A4IF30 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC35F4A4IF30 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC35F4A4IF30 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC35F4A4IF30 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC35F4A4IF30 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC35F4A4IF30 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC35F4A4IF30 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC35F4A4IF30 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC35F4A4IF30 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC35F4A4IF30 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC35F4A4IF30 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC35F4A4IF30 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC35F4A4IF30 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC35F4A4IF30 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC35F4A4IF30 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC35F4A4IF30 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC35F4A4IF30 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC35F4A4IF30 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC35F4A4IF30 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC35F4A4IF30 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC35F4A4IF30 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC35F4A4IF30 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC35F4A4IF30 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC35F4A4IF30 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC35F4A4IF30 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC35F4A4IF30 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC35F4A4IF30 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC35F4A4IF30 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC35F4A4IF30 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC35F4A4IF30 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC35F4A4IF30 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC35F4A4IF30 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC35F4A4IF30 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC35F4A4IF30 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC35F4A4IF30 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC35F4A4IF30 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC35F4A4IF30 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC35F4A4IF30 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC35F4A4IF30 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC35F4A4IF30 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC35F4A4IF30 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC35F4A4IF30 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC35F4A4IF30 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms