Protein–RNA interactions for Protein: A0A5B9

TRBC2, T-cell receptor beta-2 chain C region, humanhuman

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Length 178 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBC2A0A5B9 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRBC2A0A5B9 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRBC2A0A5B9 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRBC2A0A5B9 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRBC2A0A5B9 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRBC2A0A5B9 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRBC2A0A5B9 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
TRBC2A0A5B9 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRBC2A0A5B9 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRBC2A0A5B9 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRBC2A0A5B9 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRBC2A0A5B9 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRBC2A0A5B9 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRBC2A0A5B9 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRBC2A0A5B9 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRBC2A0A5B9 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRBC2A0A5B9 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRBC2A0A5B9 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRBC2A0A5B9 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRBC2A0A5B9 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRBC2A0A5B9 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRBC2A0A5B9 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TRBC2A0A5B9 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TRBC2A0A5B9 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
TRBC2A0A5B9 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRBC2A0A5B9 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRBC2A0A5B9 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRBC2A0A5B9 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
TRBC2A0A5B9 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
TRBC2A0A5B9 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRBC2A0A5B9 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRBC2A0A5B9 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRBC2A0A5B9 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRBC2A0A5B9 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRBC2A0A5B9 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRBC2A0A5B9 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRBC2A0A5B9 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRBC2A0A5B9 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRBC2A0A5B9 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRBC2A0A5B9 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRBC2A0A5B9 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRBC2A0A5B9 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRBC2A0A5B9 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRBC2A0A5B9 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRBC2A0A5B9 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRBC2A0A5B9 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRBC2A0A5B9 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
TRBC2A0A5B9 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
TRBC2A0A5B9 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRBC2A0A5B9 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRBC2A0A5B9 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRBC2A0A5B9 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRBC2A0A5B9 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRBC2A0A5B9 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRBC2A0A5B9 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRBC2A0A5B9 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRBC2A0A5B9 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRBC2A0A5B9 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
TRBC2A0A5B9 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRBC2A0A5B9 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRBC2A0A5B9 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRBC2A0A5B9 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRBC2A0A5B9 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRBC2A0A5B9 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRBC2A0A5B9 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRBC2A0A5B9 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRBC2A0A5B9 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRBC2A0A5B9 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRBC2A0A5B9 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRBC2A0A5B9 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRBC2A0A5B9 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRBC2A0A5B9 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRBC2A0A5B9 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRBC2A0A5B9 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRBC2A0A5B9 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRBC2A0A5B9 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TRBC2A0A5B9 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23■■□□□ 1.27
TRBC2A0A5B9 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TRBC2A0A5B9 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TRBC2A0A5B9 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TRBC2A0A5B9 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRBC2A0A5B9 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRBC2A0A5B9 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRBC2A0A5B9 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRBC2A0A5B9 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRBC2A0A5B9 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRBC2A0A5B9 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRBC2A0A5B9 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRBC2A0A5B9 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRBC2A0A5B9 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRBC2A0A5B9 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRBC2A0A5B9 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRBC2A0A5B9 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRBC2A0A5B9 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRBC2A0A5B9 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
TRBC2A0A5B9 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRBC2A0A5B9 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRBC2A0A5B9 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRBC2A0A5B9 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
TRBC2A0A5B9 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
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