Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YYF1

TRBV7-4, T-cell receptor beta variable 7-4 (gene/pseudogene) (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV7-4A0A0J9YYF1 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRBV7-4A0A0J9YYF1 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRBV7-4A0A0J9YYF1 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRBV7-4A0A0J9YYF1 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TRBV7-4A0A0J9YYF1 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TRBV7-4A0A0J9YYF1 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRBV7-4A0A0J9YYF1 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRBV7-4A0A0J9YYF1 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRBV7-4A0A0J9YYF1 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRBV7-4A0A0J9YYF1 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRBV7-4A0A0J9YYF1 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRBV7-4A0A0J9YYF1 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRBV7-4A0A0J9YYF1 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRBV7-4A0A0J9YYF1 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRBV7-4A0A0J9YYF1 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRBV7-4A0A0J9YYF1 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRBV7-4A0A0J9YYF1 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRBV7-4A0A0J9YYF1 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRBV7-4A0A0J9YYF1 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
TRBV7-4A0A0J9YYF1 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRBV7-4A0A0J9YYF1 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRBV7-4A0A0J9YYF1 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRBV7-4A0A0J9YYF1 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRBV7-4A0A0J9YYF1 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRBV7-4A0A0J9YYF1 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRBV7-4A0A0J9YYF1 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRBV7-4A0A0J9YYF1 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRBV7-4A0A0J9YYF1 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRBV7-4A0A0J9YYF1 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRBV7-4A0A0J9YYF1 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRBV7-4A0A0J9YYF1 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRBV7-4A0A0J9YYF1 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRBV7-4A0A0J9YYF1 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRBV7-4A0A0J9YYF1 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRBV7-4A0A0J9YYF1 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRBV7-4A0A0J9YYF1 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRBV7-4A0A0J9YYF1 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRBV7-4A0A0J9YYF1 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRBV7-4A0A0J9YYF1 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.8 ms