Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y625

GPC6, Glypican-6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC6Q9Y625 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GPC6Q9Y625 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GPC6Q9Y625 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GPC6Q9Y625 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GPC6Q9Y625 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GPC6Q9Y625 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GPC6Q9Y625 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GPC6Q9Y625 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GPC6Q9Y625 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GPC6Q9Y625 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GPC6Q9Y625 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GPC6Q9Y625 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GPC6Q9Y625 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GPC6Q9Y625 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GPC6Q9Y625 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GPC6Q9Y625 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GPC6Q9Y625 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GPC6Q9Y625 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GPC6Q9Y625 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GPC6Q9Y625 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GPC6Q9Y625 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GPC6Q9Y625 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GPC6Q9Y625 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GPC6Q9Y625 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GPC6Q9Y625 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GPC6Q9Y625 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GPC6Q9Y625 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GPC6Q9Y625 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GPC6Q9Y625 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GPC6Q9Y625 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GPC6Q9Y625 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GPC6Q9Y625 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GPC6Q9Y625 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GPC6Q9Y625 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GPC6Q9Y625 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GPC6Q9Y625 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
GPC6Q9Y625 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
GPC6Q9Y625 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GPC6Q9Y625 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GPC6Q9Y625 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GPC6Q9Y625 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GPC6Q9Y625 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GPC6Q9Y625 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GPC6Q9Y625 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GPC6Q9Y625 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GPC6Q9Y625 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GPC6Q9Y625 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GPC6Q9Y625 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
GPC6Q9Y625 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GPC6Q9Y625 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GPC6Q9Y625 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GPC6Q9Y625 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
GPC6Q9Y625 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GPC6Q9Y625 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GPC6Q9Y625 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GPC6Q9Y625 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GPC6Q9Y625 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GPC6Q9Y625 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GPC6Q9Y625 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GPC6Q9Y625 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GPC6Q9Y625 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GPC6Q9Y625 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GPC6Q9Y625 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GPC6Q9Y625 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
GPC6Q9Y625 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GPC6Q9Y625 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GPC6Q9Y625 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GPC6Q9Y625 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GPC6Q9Y625 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GPC6Q9Y625 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GPC6Q9Y625 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GPC6Q9Y625 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GPC6Q9Y625 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GPC6Q9Y625 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GPC6Q9Y625 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GPC6Q9Y625 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GPC6Q9Y625 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GPC6Q9Y625 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GPC6Q9Y625 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GPC6Q9Y625 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GPC6Q9Y625 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GPC6Q9Y625 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GPC6Q9Y625 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
GPC6Q9Y625 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GPC6Q9Y625 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GPC6Q9Y625 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GPC6Q9Y625 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GPC6Q9Y625 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GPC6Q9Y625 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
GPC6Q9Y625 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GPC6Q9Y625 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GPC6Q9Y625 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GPC6Q9Y625 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GPC6Q9Y625 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GPC6Q9Y625 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GPC6Q9Y625 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GPC6Q9Y625 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GPC6Q9Y625 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GPC6Q9Y625 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GPC6Q9Y625 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms