Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5X3

SNX5, Sorting nexin-5, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX5Q9Y5X3 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNX5Q9Y5X3 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNX5Q9Y5X3 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNX5Q9Y5X3 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNX5Q9Y5X3 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNX5Q9Y5X3 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNX5Q9Y5X3 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNX5Q9Y5X3 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNX5Q9Y5X3 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNX5Q9Y5X3 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SNX5Q9Y5X3 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNX5Q9Y5X3 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNX5Q9Y5X3 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNX5Q9Y5X3 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNX5Q9Y5X3 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNX5Q9Y5X3 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNX5Q9Y5X3 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNX5Q9Y5X3 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNX5Q9Y5X3 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNX5Q9Y5X3 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNX5Q9Y5X3 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNX5Q9Y5X3 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNX5Q9Y5X3 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNX5Q9Y5X3 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNX5Q9Y5X3 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNX5Q9Y5X3 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNX5Q9Y5X3 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNX5Q9Y5X3 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNX5Q9Y5X3 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNX5Q9Y5X3 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNX5Q9Y5X3 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNX5Q9Y5X3 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNX5Q9Y5X3 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNX5Q9Y5X3 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNX5Q9Y5X3 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNX5Q9Y5X3 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNX5Q9Y5X3 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNX5Q9Y5X3 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNX5Q9Y5X3 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNX5Q9Y5X3 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNX5Q9Y5X3 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNX5Q9Y5X3 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNX5Q9Y5X3 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
SNX5Q9Y5X3 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SNX5Q9Y5X3 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SNX5Q9Y5X3 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SNX5Q9Y5X3 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SNX5Q9Y5X3 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SNX5Q9Y5X3 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SNX5Q9Y5X3 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNX5Q9Y5X3 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNX5Q9Y5X3 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNX5Q9Y5X3 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNX5Q9Y5X3 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNX5Q9Y5X3 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNX5Q9Y5X3 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNX5Q9Y5X3 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNX5Q9Y5X3 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNX5Q9Y5X3 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNX5Q9Y5X3 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNX5Q9Y5X3 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SNX5Q9Y5X3 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNX5Q9Y5X3 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SNX5Q9Y5X3 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNX5Q9Y5X3 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNX5Q9Y5X3 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNX5Q9Y5X3 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SNX5Q9Y5X3 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNX5Q9Y5X3 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SNX5Q9Y5X3 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNX5Q9Y5X3 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNX5Q9Y5X3 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNX5Q9Y5X3 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNX5Q9Y5X3 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNX5Q9Y5X3 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNX5Q9Y5X3 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNX5Q9Y5X3 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNX5Q9Y5X3 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNX5Q9Y5X3 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNX5Q9Y5X3 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNX5Q9Y5X3 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SNX5Q9Y5X3 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNX5Q9Y5X3 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNX5Q9Y5X3 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNX5Q9Y5X3 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SNX5Q9Y5X3 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SNX5Q9Y5X3 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SNX5Q9Y5X3 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SNX5Q9Y5X3 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SNX5Q9Y5X3 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SNX5Q9Y5X3 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SNX5Q9Y5X3 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SNX5Q9Y5X3 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SNX5Q9Y5X3 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNX5Q9Y5X3 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNX5Q9Y5X3 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNX5Q9Y5X3 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNX5Q9Y5X3 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNX5Q9Y5X3 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNX5Q9Y5X3 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 132.2 ms