Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5G1

PCDHGB3, Protocadherin gamma-B3, humanhuman

Predictions only

Length 929 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHGB3Q9Y5G1 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCDHGB3Q9Y5G1 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCDHGB3Q9Y5G1 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCDHGB3Q9Y5G1 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCDHGB3Q9Y5G1 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCDHGB3Q9Y5G1 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCDHGB3Q9Y5G1 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCDHGB3Q9Y5G1 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCDHGB3Q9Y5G1 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCDHGB3Q9Y5G1 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCDHGB3Q9Y5G1 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCDHGB3Q9Y5G1 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCDHGB3Q9Y5G1 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCDHGB3Q9Y5G1 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCDHGB3Q9Y5G1 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCDHGB3Q9Y5G1 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCDHGB3Q9Y5G1 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCDHGB3Q9Y5G1 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PCDHGB3Q9Y5G1 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCDHGB3Q9Y5G1 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCDHGB3Q9Y5G1 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCDHGB3Q9Y5G1 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCDHGB3Q9Y5G1 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCDHGB3Q9Y5G1 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCDHGB3Q9Y5G1 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCDHGB3Q9Y5G1 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PCDHGB3Q9Y5G1 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCDHGB3Q9Y5G1 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCDHGB3Q9Y5G1 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCDHGB3Q9Y5G1 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCDHGB3Q9Y5G1 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCDHGB3Q9Y5G1 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCDHGB3Q9Y5G1 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCDHGB3Q9Y5G1 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCDHGB3Q9Y5G1 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCDHGB3Q9Y5G1 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCDHGB3Q9Y5G1 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCDHGB3Q9Y5G1 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCDHGB3Q9Y5G1 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCDHGB3Q9Y5G1 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCDHGB3Q9Y5G1 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCDHGB3Q9Y5G1 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCDHGB3Q9Y5G1 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCDHGB3Q9Y5G1 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCDHGB3Q9Y5G1 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCDHGB3Q9Y5G1 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCDHGB3Q9Y5G1 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCDHGB3Q9Y5G1 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCDHGB3Q9Y5G1 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PCDHGB3Q9Y5G1 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCDHGB3Q9Y5G1 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCDHGB3Q9Y5G1 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCDHGB3Q9Y5G1 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCDHGB3Q9Y5G1 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCDHGB3Q9Y5G1 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCDHGB3Q9Y5G1 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCDHGB3Q9Y5G1 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCDHGB3Q9Y5G1 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCDHGB3Q9Y5G1 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PCDHGB3Q9Y5G1 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCDHGB3Q9Y5G1 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCDHGB3Q9Y5G1 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCDHGB3Q9Y5G1 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCDHGB3Q9Y5G1 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCDHGB3Q9Y5G1 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCDHGB3Q9Y5G1 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCDHGB3Q9Y5G1 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCDHGB3Q9Y5G1 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCDHGB3Q9Y5G1 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCDHGB3Q9Y5G1 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCDHGB3Q9Y5G1 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCDHGB3Q9Y5G1 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCDHGB3Q9Y5G1 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCDHGB3Q9Y5G1 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
PCDHGB3Q9Y5G1 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
PCDHGB3Q9Y5G1 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCDHGB3Q9Y5G1 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCDHGB3Q9Y5G1 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCDHGB3Q9Y5G1 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PCDHGB3Q9Y5G1 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCDHGB3Q9Y5G1 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCDHGB3Q9Y5G1 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCDHGB3Q9Y5G1 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCDHGB3Q9Y5G1 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCDHGB3Q9Y5G1 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCDHGB3Q9Y5G1 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCDHGB3Q9Y5G1 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCDHGB3Q9Y5G1 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCDHGB3Q9Y5G1 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCDHGB3Q9Y5G1 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCDHGB3Q9Y5G1 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCDHGB3Q9Y5G1 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PCDHGB3Q9Y5G1 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PCDHGB3Q9Y5G1 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PCDHGB3Q9Y5G1 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PCDHGB3Q9Y5G1 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PCDHGB3Q9Y5G1 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PCDHGB3Q9Y5G1 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PCDHGB3Q9Y5G1 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PCDHGB3Q9Y5G1 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms