Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y561

LRP12, Low-density lipoprotein receptor-related protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP12Q9Y561 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LRP12Q9Y561 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LRP12Q9Y561 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LRP12Q9Y561 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
LRP12Q9Y561 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
LRP12Q9Y561 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LRP12Q9Y561 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LRP12Q9Y561 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LRP12Q9Y561 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LRP12Q9Y561 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LRP12Q9Y561 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LRP12Q9Y561 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LRP12Q9Y561 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LRP12Q9Y561 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LRP12Q9Y561 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LRP12Q9Y561 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LRP12Q9Y561 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LRP12Q9Y561 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LRP12Q9Y561 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
LRP12Q9Y561 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
LRP12Q9Y561 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
LRP12Q9Y561 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
LRP12Q9Y561 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
LRP12Q9Y561 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
LRP12Q9Y561 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
LRP12Q9Y561 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LRP12Q9Y561 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LRP12Q9Y561 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
LRP12Q9Y561 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LRP12Q9Y561 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
LRP12Q9Y561 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LRP12Q9Y561 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LRP12Q9Y561 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LRP12Q9Y561 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LRP12Q9Y561 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LRP12Q9Y561 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LRP12Q9Y561 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LRP12Q9Y561 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LRP12Q9Y561 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LRP12Q9Y561 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LRP12Q9Y561 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
LRP12Q9Y561 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LRP12Q9Y561 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LRP12Q9Y561 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LRP12Q9Y561 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
LRP12Q9Y561 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
LRP12Q9Y561 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
LRP12Q9Y561 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
LRP12Q9Y561 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
LRP12Q9Y561 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
LRP12Q9Y561 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LRP12Q9Y561 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
LRP12Q9Y561 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
LRP12Q9Y561 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LRP12Q9Y561 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LRP12Q9Y561 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
LRP12Q9Y561 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
LRP12Q9Y561 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
LRP12Q9Y561 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
LRP12Q9Y561 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LRP12Q9Y561 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LRP12Q9Y561 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
LRP12Q9Y561 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
LRP12Q9Y561 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
LRP12Q9Y561 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LRP12Q9Y561 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
LRP12Q9Y561 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LRP12Q9Y561 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LRP12Q9Y561 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LRP12Q9Y561 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LRP12Q9Y561 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LRP12Q9Y561 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LRP12Q9Y561 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LRP12Q9Y561 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LRP12Q9Y561 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LRP12Q9Y561 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
LRP12Q9Y561 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LRP12Q9Y561 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LRP12Q9Y561 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LRP12Q9Y561 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LRP12Q9Y561 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LRP12Q9Y561 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LRP12Q9Y561 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LRP12Q9Y561 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LRP12Q9Y561 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LRP12Q9Y561 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LRP12Q9Y561 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LRP12Q9Y561 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LRP12Q9Y561 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LRP12Q9Y561 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LRP12Q9Y561 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LRP12Q9Y561 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LRP12Q9Y561 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LRP12Q9Y561 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LRP12Q9Y561 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LRP12Q9Y561 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LRP12Q9Y561 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LRP12Q9Y561 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LRP12Q9Y561 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LRP12Q9Y561 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms