Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y546

LRRC42, Leucine-rich repeat-containing protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC42Q9Y546 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRRC42Q9Y546 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRRC42Q9Y546 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRRC42Q9Y546 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRRC42Q9Y546 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
LRRC42Q9Y546 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
LRRC42Q9Y546 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
LRRC42Q9Y546 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
LRRC42Q9Y546 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
LRRC42Q9Y546 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
LRRC42Q9Y546 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
LRRC42Q9Y546 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
LRRC42Q9Y546 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
LRRC42Q9Y546 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LRRC42Q9Y546 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LRRC42Q9Y546 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRRC42Q9Y546 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRRC42Q9Y546 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRRC42Q9Y546 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRRC42Q9Y546 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRRC42Q9Y546 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRRC42Q9Y546 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRRC42Q9Y546 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRRC42Q9Y546 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRRC42Q9Y546 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRRC42Q9Y546 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRRC42Q9Y546 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRRC42Q9Y546 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRRC42Q9Y546 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRRC42Q9Y546 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRRC42Q9Y546 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRRC42Q9Y546 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
LRRC42Q9Y546 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRRC42Q9Y546 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRRC42Q9Y546 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRRC42Q9Y546 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRRC42Q9Y546 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRRC42Q9Y546 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRRC42Q9Y546 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRRC42Q9Y546 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRRC42Q9Y546 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRRC42Q9Y546 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRRC42Q9Y546 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRRC42Q9Y546 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRRC42Q9Y546 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRRC42Q9Y546 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRRC42Q9Y546 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRRC42Q9Y546 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRRC42Q9Y546 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRRC42Q9Y546 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRRC42Q9Y546 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LRRC42Q9Y546 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LRRC42Q9Y546 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LRRC42Q9Y546 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LRRC42Q9Y546 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
LRRC42Q9Y546 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRC42Q9Y546 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRC42Q9Y546 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRC42Q9Y546 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRC42Q9Y546 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRC42Q9Y546 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRRC42Q9Y546 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRRC42Q9Y546 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRRC42Q9Y546 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
LRRC42Q9Y546 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRRC42Q9Y546 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRRC42Q9Y546 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRRC42Q9Y546 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRRC42Q9Y546 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRRC42Q9Y546 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRRC42Q9Y546 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRRC42Q9Y546 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRC42Q9Y546 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRC42Q9Y546 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRC42Q9Y546 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRC42Q9Y546 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRC42Q9Y546 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRC42Q9Y546 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRC42Q9Y546 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRC42Q9Y546 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRC42Q9Y546 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRC42Q9Y546 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRC42Q9Y546 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRC42Q9Y546 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRC42Q9Y546 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRC42Q9Y546 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRC42Q9Y546 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRC42Q9Y546 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRC42Q9Y546 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRC42Q9Y546 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRC42Q9Y546 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRC42Q9Y546 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRC42Q9Y546 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRC42Q9Y546 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRC42Q9Y546 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRC42Q9Y546 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRC42Q9Y546 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRC42Q9Y546 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRC42Q9Y546 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRC42Q9Y546 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms