Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y535

POLR3H, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3HQ9Y535 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
POLR3HQ9Y535 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
POLR3HQ9Y535 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
POLR3HQ9Y535 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
POLR3HQ9Y535 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
POLR3HQ9Y535 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
POLR3HQ9Y535 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
POLR3HQ9Y535 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
POLR3HQ9Y535 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
POLR3HQ9Y535 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
POLR3HQ9Y535 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
POLR3HQ9Y535 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
POLR3HQ9Y535 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
POLR3HQ9Y535 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
POLR3HQ9Y535 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
POLR3HQ9Y535 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
POLR3HQ9Y535 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
POLR3HQ9Y535 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
POLR3HQ9Y535 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
POLR3HQ9Y535 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
POLR3HQ9Y535 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
POLR3HQ9Y535 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
POLR3HQ9Y535 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
POLR3HQ9Y535 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
POLR3HQ9Y535 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
POLR3HQ9Y535 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
POLR3HQ9Y535 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
POLR3HQ9Y535 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
POLR3HQ9Y535 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
POLR3HQ9Y535 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
POLR3HQ9Y535 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
POLR3HQ9Y535 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
POLR3HQ9Y535 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
POLR3HQ9Y535 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
POLR3HQ9Y535 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
POLR3HQ9Y535 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
POLR3HQ9Y535 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
POLR3HQ9Y535 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
POLR3HQ9Y535 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
POLR3HQ9Y535 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
POLR3HQ9Y535 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
POLR3HQ9Y535 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
POLR3HQ9Y535 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
POLR3HQ9Y535 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
POLR3HQ9Y535 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
POLR3HQ9Y535 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
POLR3HQ9Y535 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
POLR3HQ9Y535 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
POLR3HQ9Y535 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
POLR3HQ9Y535 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
POLR3HQ9Y535 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
POLR3HQ9Y535 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
POLR3HQ9Y535 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
POLR3HQ9Y535 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
POLR3HQ9Y535 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
POLR3HQ9Y535 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
POLR3HQ9Y535 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
POLR3HQ9Y535 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
POLR3HQ9Y535 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
POLR3HQ9Y535 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
POLR3HQ9Y535 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
POLR3HQ9Y535 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
POLR3HQ9Y535 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
POLR3HQ9Y535 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
POLR3HQ9Y535 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
POLR3HQ9Y535 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
POLR3HQ9Y535 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
POLR3HQ9Y535 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
POLR3HQ9Y535 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
POLR3HQ9Y535 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
POLR3HQ9Y535 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
POLR3HQ9Y535 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
POLR3HQ9Y535 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
POLR3HQ9Y535 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
POLR3HQ9Y535 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
POLR3HQ9Y535 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
POLR3HQ9Y535 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
POLR3HQ9Y535 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
POLR3HQ9Y535 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
POLR3HQ9Y535 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
POLR3HQ9Y535 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
POLR3HQ9Y535 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
POLR3HQ9Y535 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
POLR3HQ9Y535 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
POLR3HQ9Y535 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
POLR3HQ9Y535 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
POLR3HQ9Y535 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
POLR3HQ9Y535 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
POLR3HQ9Y535 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
POLR3HQ9Y535 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
POLR3HQ9Y535 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
POLR3HQ9Y535 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
POLR3HQ9Y535 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
POLR3HQ9Y535 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
POLR3HQ9Y535 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
POLR3HQ9Y535 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
POLR3HQ9Y535 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
POLR3HQ9Y535 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
POLR3HQ9Y535 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
POLR3HQ9Y535 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.1 ms